RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332029.2

SOCS1-201, Transcript of suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOCS1, Length 1,225 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1-201ENST00000332029 GCLMP48507 274 aa22.31■■□□□ 1.16
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SOCS1-201ENST00000332029 BTBD8Q5XKL5 378 aa22.31■■□□□ 1.16
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SOCS1-201ENST00000332029 SLC2A14Q8TDB8 520 aa22.31■■□□□ 1.16
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SOCS1-201ENST00000332029 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
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SOCS1-201ENST00000332029 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
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SOCS1-201ENST00000332029 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa22.28■■□□□ 1.16
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SOCS1-201ENST00000332029 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
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SOCS1-201ENST00000332029 ADORA2BP29275 332 aa22.27■■□□□ 1.16
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SOCS1-201ENST00000332029 PTGER3P43115 390 aa22.27■■□□□ 1.16
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SOCS1-201ENST00000332029 TRIM61Q5EBN2 209 aa22.27■■□□□ 1.16
SOCS1-201ENST00000332029 C10orf76Q5T2E6 689 aa22.27■■□□□ 1.16
SOCS1-201ENST00000332029 NUDT18Q6ZVK8 323 aa22.27■■□□□ 1.16
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SOCS1-201ENST00000332029 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
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SOCS1-201ENST00000332029 KCNV2Q8TDN2 545 aa22.27■■□□□ 1.16
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SOCS1-201ENST00000332029 NIF3L1Q9GZT8 377 aa22.27■■□□□ 1.16
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SOCS1-201ENST00000332029 KRT39Q6A163 491 aa22.26■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 CYFIP2Q96F07 1278 aa22.26■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 EEF2KMTQ96G04 330 aa22.26■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 TMEM74BQ9NUR3 256 aa22.26■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 RMND1Q9NWS8 449 aa22.26■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.25■■□□□ 1.15
SOCS1-201ENST00000332029 CETN3O15182 167 aa22.25■■□□□ 1.15
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