RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 CCDC89Q8N998 374 aa20■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 RNF157Q96PX1 679 aa20■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 NPY6RQ99463 290 aa20■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 FAM129AQ9BZQ8 928 aa20■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 PNPLA8Q9NP80 782 aa20■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa20■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 FAN1Q9Y2M0 1017 aa20■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa19.99■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 AGPSO00116 658 aa19.99■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 CAPN9O14815 690 aa19.99■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 APOC2P02655 101 aa19.99■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 FYNP06241 537 aa19.99■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 ITGAVP06756 1048 aa19.99■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 OR4Q2P0C623 313 aa19.99■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 ITIH2P19823 946 aa19.99■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 IVDP26440 423 aa19.99■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 GGCXP38435 758 aa19.99■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 ADCY8P40145 1251 aa19.99■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 SLC11A1P49279 550 aa19.99■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 FAM193AP78312 1265 aa19.99■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 TFDP2Q14188 446 aa19.99■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 SLC39A12Q504Y0 691 aa19.99■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 HSP90B2PQ58FF3 399 aa19.99■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 BNIPLQ7Z465 357 aa19.99■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 TMC3Q7Z5M5 1100 aa19.99■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 VSIG1Q86XK7 387 aa19.99■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 ALLCQ8N6M5 410 aa19.99■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 FAM71BQ8TC56 605 aa19.99■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa19.99■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 TMEM39AQ9NV64 488 aa19.99■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 HCSTQ9UBK5 93 aa19.99■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 KRT14P02533 472 aa19.98■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 ATF2P15336 505 aa19.98■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 KLRC2P26717 231 aa19.98■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 OAS2P29728 719 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 GJA8P48165 433 aa19.98■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 DPYSL2Q16555 572 aa19.98■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 CFAP58Q5T655 872 aa19.98■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 FAM171A1Q5VUB5 890 aa19.98■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 PM20D1Q6GTS8 502 aa19.98■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 CEP57Q86XR8 500 aa19.98■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 IQCKQ8N0W5 287 aa19.98■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 CCDC185Q8N715 623 aa19.98■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 ARMC5Q96C12 935 aa19.98■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 SNF8Q96H20 258 aa19.98■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 GPR62Q9BZJ7 368 aa19.98■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 MED4Q9NPJ6 270 aa19.98■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 M0QYT0 321 aa19.98■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 LTFP02788 710 aa19.98■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 CYP2F1P24903 491 aa19.98■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 L1CAMP32004 1257 aa19.98■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa19.98■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP19.98■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 BHLHA9Q7RTU4 235 aa19.98■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 FAM131BQ86XD5 332 aa19.98■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 IRGQQ8WZA9 623 aa19.98■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 ZNF670Q9BS34 389 aa19.98■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 TMEM175Q9BSA9 504 aa19.98■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 TMEM121Q9BTD3 319 aa19.98■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 MARCH5Q9NX47 278 aa19.98■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 AP4E1Q9UPM8 1137 aa19.98■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 TP73O15350 636 aa19.97■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 SYF2O95926 243 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 GALTP07902 379 aa19.97■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 NCAM1P13591 858 aa19.97■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 RDXP35241 583 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 HSD17B3P37058 310 aa19.97■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 GRIK1P39086 918 aa19.97■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 VPS41P49754 854 aa19.97■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 IKBKEQ14164 716 aa19.97■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 PRUNE1Q86TP1 453 aa19.97■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 ANKLE1Q8NAG6 615 aa19.97■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 CCHCR1Q8TD31 782 aa19.97■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 PIK3R5Q8WYR1 880 aa19.97■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 ZIM3Q96PE6 472 aa19.97■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 USP3Q9Y6I4 520 aa19.97■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP19.97■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 NLRC5Q86WI3 1866 aa19.97■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa19.96■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 ZNF487B1APH4 448 aa19.96■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 PPFIA2O75334 1257 aa19.96■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 CLTBP09497 229 aa19.96■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 DEUP1Q05D60 604 aa19.96■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 CNKSR3Q6P9H4 555 aa19.96■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 SCML4Q8N228 414 aa19.96■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 SLC7A14Q8TBB6 771 aa19.96■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 P3H4Q92791 437 aa19.96■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 FAF2Q96CS3 445 aa19.96■□□□□ 0.79
UPP1-201ENST00000331803 TXLNGYQ9BZA5 131 aa19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms