RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321358.11

YBX1-201, Transcript of Y-box binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene YBX1, Length 1,514 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX1-201ENST00000321358 ARCQ7LC44 396 aa22.15■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 SCD5Q86SK9 330 aa22.15■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 SMRP1Q8NCR6 262 aa22.15■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa22.15■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 TRPC7Q9HCX4 862 aa22.15■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 ADGRG1Q9Y653 693 aa22.15■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 MYH10P35580 1976 aa22.15■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 RARGP13631 454 aa22.14■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 TUBP50607 506 aa22.14■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 TAF5Q15542 800 aa22.14■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 DCAF6Q58WW2 860 aa22.14■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 BHLHA9Q7RTU4 235 aa22.14■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 RHOT2Q8IXI1 618 aa22.14■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 EDEM1Q92611 657 aa22.14■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 MCEEQ96PE7 176 aa22.14■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 NUP85Q9BW27 656 aa22.14■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 NMUR1Q9HB89 426 aa22.14■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 UVRAGQ9P2Y5 699 aa22.14■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 CLUHO75153 1309 aa22.13■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 TLR5O60602 858 aa22.13■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 C10orf120Q5SQS8 335 aa22.13■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 HFE2Q6ZVN8 426 aa22.13■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 TMEM150AQ86TG1 271 aa22.13■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 SHKBP1Q8TBC3 707 aa22.13■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 FEZF2Q8TBJ5 459 aa22.13■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 RRN3Q9NYV6 651 aa22.13■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 TMEM59LQ9UK28 342 aa22.13■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 STAP1Q9ULZ2 295 aa22.13■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa22.13■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 SOBPA7XYQ1 873 aa22.12■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 DAB1O75553 588 aa22.12■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 PDGFRAP16234 1089 aa22.12■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 GJA1P17302 382 aa22.12■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 PFKLP17858 780 aa22.12■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 NOS2P35228 1153 aa22.12■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 CCR2P41597 374 aa22.12■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 MATKP42679 507 aa22.12■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 NOP2P46087 812 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 CYP4F8P98187 520 aa22.12■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 PRSS36Q5K4E3 855 aa22.12■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 GPR158Q5T848 1215 aa22.12■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 DEFB106AQ8N104 65 aa22.12■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 RFFLQ8WZ73 363 aa22.12■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 ARHGEF26Q96DR7 871 aa22.12■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 TCEAL4Q96EI5 215 aa22.12■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 TSGA10Q9BZW7 698 aa22.12■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 ZSCAN12O43309 604 aa22.11■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 TADA3O75528 432 aa22.11■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 SDC4P31431 198 aa22.11■■□□□ 1.13
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YBX1-201ENST00000321358 SLC5A9Q2M3M2 681 aa22.11■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 TXNDC8Q6A555 127 aa22.11■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 ZNF276Q8N554 614 aa22.11■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 SLC35G2Q8TBE7 412 aa22.11■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 SLC2A13Q96QE2 648 aa22.11■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 TASP1Q9H6P5 420 aa22.11■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 OSER1Q9NX31 292 aa22.11■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
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YBX1-201ENST00000321358 DNMT3LQ9UJW3 386 aa22.11■■□□□ 1.13
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YBX1-201ENST00000321358 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa22.11■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa22.11■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 KRT86O43790 486 aa22.11■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 HDCP19113 662 aa22.11■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 AVPR1AP37288 418 aa22.11■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 PGFP49763 221 aa22.11■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
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YBX1-201ENST00000321358 HS1BP3Q53T59 392 aa22.11■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa22.11■■□□□ 1.13
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YBX1-201ENST00000321358 EMC1Q8N766 993 aa22.11■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 MAB21L3Q8N8X9 362 aa22.11■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 RXFP2Q8WXD0 754 aa22.11■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 ING5Q8WYH8 240 aa22.11■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.136e-7■■□□□ 13.9
YBX1-201ENST00000321358 CCSER2Q9H7U1 834 aa22.11■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 TMEM51Q9NW97 253 aa22.11■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 FAM50BQ9Y247 325 aa22.11■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 EYSQ5T1H1 3165 aa22.1■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 TMEM191CA6NGB0 347 aa22.1■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 MYO1FO00160 1098 aa22.1■■□□□ 1.13
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