RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318978.5

CTXN1-201, Transcript of cortexin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN1, Length 1,274 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1-201ENST00000318978 ZNF132P52740 706 aa26.75■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 CCINQ13939 588 aa26.75■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 STX1AQ16623 288 aa26.75■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 TCP11X2Q5H9J9 407 aa26.75■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 FSTL4Q6MZW2 842 aa26.75■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 Q6ZS52 159 aa26.75■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 MIB1Q86YT6 1006 aa26.75■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 CD101Q93033 1021 aa26.75■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 ZSWIM1Q9BR11 485 aa26.75■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 RASAL2Q9UJF2 1139 aa26.75■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 CNTN6Q9UQ52 1028 aa26.75■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 ATG2BQ96BY7 2078 aa26.74■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 CACNA1HO95180 2353 aa26.74■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 MED7O43513 233 aa26.74■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 ADH1CP00326 375 aa26.74■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 CCR3P51677 355 aa26.74■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 DHCR24Q15392 516 aa26.74■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 PKDCCQ504Y2 493 aa26.74■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 MIIPQ5JXC2 388 aa26.74■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 KLHDC10Q6PID8 442 aa26.74■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 TSSK4Q6SA08 328 aa26.74■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 SYNPOQ8N3V7 929 aa26.74■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 OTUB2Q96DC9 234 aa26.74■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 PIK3R2O00459 728 aa26.73■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 THAP12O43422 761 aa26.73■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 EGFP01133 1207 aa26.73■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 DRD1P21728 446 aa26.73■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 NBL1P41271 181 aa26.73■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 EFEMP1Q12805 493 aa26.73■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 BTBD8Q5XKL5 378 aa26.73■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 PM20D1Q6GTS8 502 aa26.73■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 BBS7Q8IWZ6 715 aa26.73■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 SPEM1Q8N4L4 309 aa26.73■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 KCTD13Q8WZ19 329 aa26.73■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 WBP2Q969T9 261 aa26.73■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 R4GN57 208 aa26.73■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 TPM2P07951 284 aa26.72■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 ADH5P11766 374 aa26.72■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 GNA15P30679 374 aa26.72■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 CXCL12P48061 93 aa26.72■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 GAS6Q14393 721 aa26.72■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 PMF1Q6P1K2 205 aa26.72■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 SLC35F5Q8WV83 523 aa26.72■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 TAB2Q9NYJ8 693 aa26.72■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 STRIP2Q9ULQ0 834 aa26.72■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 HMBSP08397 361 aa26.71■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 ZNF528Q3MIS6 628 aa26.71■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 LY6G5CQ5SRR4 150 aa26.71■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 RHBDF2Q6PJF5 856 aa26.71■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 HTR3DQ70Z44 454 aa26.71■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 ZNF276Q8N554 614 aa26.71■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 CNGB3Q9NQW8 809 aa26.71■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 DNAJC12Q9UKB3 198 aa26.71■■□□□ 1.87
CTXN1-201ENST00000318978 COG7P83436 770 aa26.7■■□□□ 1.86
CTXN1-201ENST00000318978 SATB1Q01826 763 aa26.7■■□□□ 1.86
CTXN1-201ENST00000318978 ANO4Q32M45 955 aa26.7■■□□□ 1.86
CTXN1-201ENST00000318978 RNF139Q8WU17 664 aa26.7■■□□□ 1.86
CTXN1-201ENST00000318978 ZNF606Q8WXB4 792 aa26.7■■□□□ 1.86
CTXN1-201ENST00000318978 ST7Q9NRC1 585 aa26.7■■□□□ 1.86
CTXN1-201ENST00000318978 MARCH2Q9P0N8 246 aa26.7■■□□□ 1.86
CTXN1-201ENST00000318978 TMEM63CQ9P1W3 806 aa26.7■■□□□ 1.86
CTXN1-201ENST00000318978 RNF40O75150 1001 aa26.69■■□□□ 1.86
CTXN1-201ENST00000318978 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
CTXN1-201ENST00000318978 OPRD1P41143 372 aa26.69■■□□□ 1.86
CTXN1-201ENST00000318978 GAD2Q05329 585 aa26.69■■□□□ 1.86
CTXN1-201ENST00000318978 FBXO43Q4G163 708 aa26.69■■□□□ 1.86
CTXN1-201ENST00000318978 DENND1BQ6P3S1 775 aa26.69■■□□□ 1.86
CTXN1-201ENST00000318978 MAMSTRQ6ZN01 415 aa26.69■■□□□ 1.86
CTXN1-201ENST00000318978 ATRIPQ8WXE1 791 aa26.69■■□□□ 1.86
CTXN1-201ENST00000318978 EDEM1Q92611 657 aa26.69■■□□□ 1.86
CTXN1-201ENST00000318978 GOLGA1Q92805 767 aa26.69■■□□□ 1.86
CTXN1-201ENST00000318978 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
CTXN1-201ENST00000318978 MIS12Q9H081 205 aa26.69■■□□□ 1.86
CTXN1-201ENST00000318978 VPS16Q9H269 839 aa26.69■■□□□ 1.86
CTXN1-201ENST00000318978 SIX2Q9NPC8 291 aa26.69■■□□□ 1.86
CTXN1-201ENST00000318978 ACP6Q9NPH0 428 aa26.69■■□□□ 1.86
CTXN1-201ENST00000318978 SPHK2Q9NRA0 654 aa26.69■■□□□ 1.86
CTXN1-201ENST00000318978 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
CTXN1-201ENST00000318978 FANCLQ9NW38 375 aa26.69■■□□□ 1.86
CTXN1-201ENST00000318978 FANCMQ8IYD8 2048 aa26.68■■□□□ 1.86
CTXN1-201ENST00000318978 SLC12A8A0AV02 714 aa26.68■■□□□ 1.86
CTXN1-201ENST00000318978 YJEFN3A6XGL0 299 aa26.68■■□□□ 1.86
CTXN1-201ENST00000318978 BECN2A8MW95 431 aa26.68■■□□□ 1.86
CTXN1-201ENST00000318978 E7ENQ6 273 aa26.68■■□□□ 1.86
CTXN1-201ENST00000318978 PROB1E7EW31 1015 aa26.68■■□□□ 1.86
CTXN1-201ENST00000318978 ATG13O75143 517 aa26.68■■□□□ 1.86
CTXN1-201ENST00000318978 STC2O76061 302 aa26.68■■□□□ 1.86
CTXN1-201ENST00000318978 DAOAP59103 153 aa26.68■■□□□ 1.86
CTXN1-201ENST00000318978 MYL5Q02045 173 aa26.68■■□□□ 1.86
CTXN1-201ENST00000318978 RAPGEF1Q13905 1077 aa26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms