RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295874.14

PTPRG-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRG, Length 4,650 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-201ENST00000295874 SP110Q9HB58 689 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 CLCA2Q9UQC9 943 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 C5orf60A6NFR6 353 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 UBXN8O00124 270 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 RASSF9O75901 435 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 CHKAP35790 457 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 NOMO3P69849 1222 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF235Q14590 738 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 MTFR1Q15390 333 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 MPZL3Q6UWV2 235 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 ANKS3Q6ZW76 656 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 SAMD7Q7Z3H4 446 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 DEFB132Q7Z7B7 95 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 ARMC2Q8NEN0 867 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 YME1L1Q96TA2 773 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 PAFAH2Q99487 392 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 HTATIP2Q9BUP3 242 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 PORCNQ9H237 461 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 COQ4Q9Y3A0 265 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 C16orf96A6NNT2 1141 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 A8MXQ7 604 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 ADCY3O60266 1144 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 DNAJC6O75061 913 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 CHRNB2P17787 502 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 PEX5P50542 639 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 TMEM132DQ14C87 1099 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 YIPF2Q9BWQ6 316 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 NFASCO94856 1347 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 TM9SF1O15321 606 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 HBP1O60381 514 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 MYO1DO94832 1006 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 TARSP26639 723 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 XRCC4Q13426 336 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 IMPG1Q17R60 797 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 NBPF20Q3BBV1 942 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 DCAF12L1Q5VU92 463 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 KIF12Q96FN5 646 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 NT5C1AQ9BXI3 368 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 CPT1AP50416 773 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 ENPEPQ07075 957 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 ZDHHC24Q6UX98 284 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 DTNBP1Q96EV8 351 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 C10orf88Q9H8K7 445 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 BLOC1S6Q9UL45 172 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 H0YGN5 161 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 SNX2O60749 519 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 NBNO60934 754 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 PTP4A2Q12974 167 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 KCNT1Q5JUK3 1230 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 LRRC6Q86X45 466 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 FAM161BQ96MY7 647 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 TMEM134Q9H6X4 195 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 SLC38A7Q9NVC3 462 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 NFS1Q9Y697 457 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 BCORQ6W2J9 1755 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 RPTORQ8N122 1335 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 LIASO43766 372 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 PGM1P36871 562 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 CEP78Q5JTW2 689 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 LUZP2Q86TE4 346 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 CRYGNQ8WXF5 182 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 NSL1Q96IY1 281 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 FAM167BQ9BTA0 163 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP12.72□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 HAO1Q9UJM8 370 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 FBXL21Q9UKT6 434 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 CCNE2O96020 404 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 CALCAP01258 141 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 SLITRK1Q96PX8 696 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 OSBPL7Q9BZF2 842 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 KIAA1257Q9ULG3 409 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 A0A1B0GUL6 1792 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 NHSL1Q5SYE7 1610 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 ALDH1A2O94788 518 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 VDRP11473 427 aa12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms