RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 F8W810 466 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 JCHAINP01591 159 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 FCGR1AP12314 374 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 PDPK2PQ6A1A2 396 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 DDHD1Q8NEL9 900 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF606Q8WXB4 792 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 SH3GL1Q99961 368 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC10BA6NIK2 292 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 ST3GAL1Q11201 340 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 GDF3Q9NR23 364 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 NFIBO00712 420 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 ATP6V1G2O95670 118 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 LHX1P48742 406 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 RARRES1P49788 294 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 NFYCQ13952 458 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 FUT11Q495W5 492 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC81Q6ZN84 652 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 NT5DC3Q86UY8 548 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
CCSAP-201ENST00000284617 MMRN1Q13201 1228 aa21.77■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 SLC22A9Q8IVM8 553 aa21.77■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 TERB1Q8NA31 727 aa21.77■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 DSEQ9UL01 958 aa21.77■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 MPOP05164 745 aa21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 CYP2F1P24903 491 aa21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 RPL21P46778 160 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC8DQ7L1W4 858 aa21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 TATDN2Q93075 761 aa21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 GPAMQ9HCL2 828 aa21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 ITGA11Q9UKX5 1188 aa21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 UPP2O95045 317 aa21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 CRTAMO95727 393 aa21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 E9PBE3 544 aa21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 KLHL41O60662 606 aa21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 TP53BP2Q13625 1128 aa21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 MYO1HQ8N1T3 1032 aa21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 KCND1Q9NSA2 647 aa21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 ZCCHC18P0CG32 403 aa21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 IL1R1P14778 569 aa21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC15Q0P6D6 951 aa21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 METTL7BQ6UX53 244 aa21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa21.76■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 SERPINE1P05121 402 aa21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 BMPR2Q13873 1038 aa21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 NIPA1Q7RTP0 329 aa21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 SIKE1Q9BRV8 207 aa21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 VANGL2Q9ULK5 521 aa21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1B0GW55 424 aa21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 DUX4L2P0CJ85 424 aa21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 DUX4L3P0CJ86 424 aa21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 DUX4L4P0CJ87 422 aa21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 DUX4L5P0CJ88 424 aa21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 DUX4L6P0CJ89 424 aa21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 DUX4L7P0CJ90 424 aa21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 PYGMP11217 842 aa21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 ELK3P41970 407 aa21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 PRKAA2P54646 552 aa21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 IZUMO2Q6UXV1 221 aa21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 FBXO32Q969P5 355 aa21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 CYP4F12Q9HCS2 524 aa21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 DUX4Q9UBX2 424 aa21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 GP5P40197 560 aa21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 RAP1GAPP47736 663 aa21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 PRKAA1Q13131 559 aa21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM16LQ309B1 348 aa21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC153Q494R4 210 aa21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 KYQ8NBH2 561 aa21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 FICDQ9BVA6 458 aa21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 IL17RBQ9NRM6 502 aa21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 H7C4K7 107 aa21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 RARAP10276 462 aa21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 ERMARDQ5T6L9 678 aa21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 IYDQ6PHW0 289 aa21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 CREG2Q8IUH2 290 aa21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 DNERQ8NFT8 737 aa21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 TBC1D13Q9NVG8 400 aa21.75■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 FRMPD4Q14CM0 1322 aa21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.3 ms