RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 CD151P48509 253 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 SNAPC2Q13487 334 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 TBCCQ15814 346 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 ABCB5Q2M3G0 1257 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 RELL1Q8IUW5 271 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 MARVELD2Q8N4S9 558 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 PLEKHO2Q8TD55 490 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 SLC35B4Q969S0 331 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 TRIM11Q96F44 468 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 FAM20AQ96MK3 541 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 HEPHQ9BQS7 1158 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 KLHL25Q9H0H3 589 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 GPRC5CQ9NQ84 441 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 DYTNA2CJ06 578 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 K7EPI3 171 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 HMOX2P30519 316 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 CDKL1Q00532 357 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 ART3Q13508 389 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 TRIM16LQ309B1 348 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 EML3Q32P44 896 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 MFSD14BQ5SR56 506 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 SLFN13Q68D06 897 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 FBXO11Q86XK2 927 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 ZFPM1Q8IX07 1006 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 PHTF2Q8N3S3 785 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 HSPH1Q92598 858 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 SLITRK1Q96PX8 696 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 LXNQ9BS40 222 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 C20orf27Q9GZN8 174 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 TRPC7Q9HCX4 862 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 EBF1Q9UH73 591 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 CEPT1Q9Y6K0 416 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM150BA6NC51 233 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 RGL2O15211 777 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 GNPATO15228 680 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 ITGAXP20702 1163 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 SMARCA1P28370 1054 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 ADSSP30520 456 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 RPS6P62753 249 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 CEP55Q53EZ4 464 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 SLC26A11Q86WA9 606 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 KATNAL2Q8IYT4 538 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 AHI1Q8N157 1196 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 RSPH1Q8WYR4 309 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 VPS50Q96JG6 964 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 EPB41L1Q9H4G0 881 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 RAB6BQ9NRW1 208 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 FUOMA2VDF0 154 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 CAPN15O75808 1086 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 KRT38O76015 456 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 S100BP04271 92 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 ETV4P43268 484 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 SPIRE1Q08AE8 756 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 TCP10Q12799 353 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 GPR107Q5VW38 600 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 HAUS6Q7Z4H7 955 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 CXorf38Q8TB03 319 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 ADAM32Q8TC27 787 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 NACA2Q9H009 215 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM206Q9H813 350 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 PLLPQ9Y342 182 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 SNX13Q9Y5W8 968 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 CCDC130P13994 396 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 CPOXP36551 454 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 SLC1A6P48664 564 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 PERM1Q5SV97 790 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 POTEAQ6S8J7 498 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 DPH6Q7L8W6 267 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 C7orf26Q96N11 449 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 AMNQ9BXJ7 453 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 DMAC2Q9NW81 257 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 EPS15L1Q9UBC2 864 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 HSPA4LO95757 839 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 APRTP07741 180 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 GNA15P30679 374 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 CLK2P49760 499 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 NR1D2Q14995 579 aa11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms