RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264779.6

GPBP1-201, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPBP1, Length 1,786 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1-201ENST00000264779 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa3.66□□□□□ -1.82
GPBP1-201ENST00000264779 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
GPBP1-201ENST00000264779 MORC4Q8TE76 937 aa3.66□□□□□ -1.82
GPBP1-201ENST00000264779 ZBTB9Q96C00 473 aa3.66□□□□□ -1.82
GPBP1-201ENST00000264779 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
GPBP1-201ENST00000264779 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa3.66□□□□□ -1.82
GPBP1-201ENST00000264779 RIMKLBQ9ULI2 386 aa3.66□□□□□ -1.82
GPBP1-201ENST00000264779 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa3.66□□□□□ -1.82
GPBP1-201ENST00000264779 AQP7P3A6NL99 342 aa3.66□□□□□ -1.82
GPBP1-201ENST00000264779 FCHO1O14526 889 aa3.66□□□□□ -1.82
GPBP1-201ENST00000264779 ADAM10O14672 748 aa3.66□□□□□ -1.82
GPBP1-201ENST00000264779 DSCR3O14972 297 aa3.66□□□□□ -1.82
GPBP1-201ENST00000264779 CARSP49589 748 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
GPBP1-201ENST00000264779 PLCD1P51178 756 aa3.66□□□□□ -1.82
GPBP1-201ENST00000264779 KCNB1Q14721 858 aa3.66□□□□□ -1.82
GPBP1-201ENST00000264779 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
GPBP1-201ENST00000264779 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
GPBP1-201ENST00000264779 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
GPBP1-201ENST00000264779 SMC5Q8IY18 1101 aa3.66□□□□□ -1.82
GPBP1-201ENST00000264779 METTL25Q8N6Q8 603 aa3.66□□□□□ -1.82
GPBP1-201ENST00000264779 NANOGP1Q8N7R0 232 aa3.66□□□□□ -1.82
GPBP1-201ENST00000264779 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
GPBP1-201ENST00000264779 ASAP1Q9ULH1 1129 aa3.66□□□□□ -1.82
GPBP1-201ENST00000264779 A1BGP04217 495 aa3.65□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 MCM5P33992 734 aa3.65□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 DEUP1Q05D60 604 aa3.65□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 GBX1Q14549 363 aa3.65□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 GFOD2Q3B7J2 385 aa3.65□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 C4orf46Q504U0 113 aa3.65□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 PXDC1Q5TGL8 231 aa3.65□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 CCDC181Q5TID7 509 aa3.65□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 CLEC9AQ6UXN8 241 aa3.65□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 USP49Q70CQ1 688 aa3.65□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 C14orf80Q86SX3 495 aa3.65□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 LINC01465Q8N7H1 131 aa3.65□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa3.65□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 APOL5Q9BWW9 433 aa3.65□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 FAM83DQ9H4H8 585 aa3.65□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 DNAJB11Q9UBS4 358 aa3.65□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 DKK4Q9UBT3 224 aa3.65□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 ZNF212Q9UDV6 495 aa3.65□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 SNX2O60749 519 aa3.64□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 PEX14O75381 377 aa3.64□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 INMTO95050 263 aa3.64□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 HRGP04196 525 aa3.64□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 RHCEP18577 417 aa3.64□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 BTF3P20290 206 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 RHDQ02161 417 aa3.64□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 GALEQ14376 348 aa3.64□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 MFSD13AQ14CX5 517 aa3.64□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 SEC23BQ15437 767 aa3.64□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 PLAG1Q6DJT9 500 aa3.64□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 SHC4Q6S5L8 630 aa3.64□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 RANBP10Q6VN20 620 aa3.64□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 CUL5Q93034 780 aa3.64□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 EVI5LQ96CN4 794 aa3.64□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 TRIM36Q9NQ86 728 aa3.64□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 TBC1D23Q9NUY8 699 aa3.64□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 HPSEQ9Y251 543 aa3.64□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa3.64□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 F8W8V4 182 aa3.63□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 MT-ND5P03915 603 aa3.63□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 CD19P15391 556 aa3.63□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 ATF3P18847 181 aa3.63□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 RBL1P28749 1068 aa3.63□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 CCT4P50991 539 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 GHRHRQ02643 423 aa3.63□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 ST3GAL2Q16842 350 aa3.63□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 TMTC4Q5T4D3 741 aa3.63□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 MANEALQ5VSG8 457 aa3.63□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 C9orf106Q8NAJ2 232 aa3.63□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 TTC8Q8TAM2 541 aa3.63□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 ZNF398Q8TD17 642 aa3.63□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 MAP4K1Q92918 833 aa3.63□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 TIFAQ96CG3 184 aa3.63□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 VPS50Q96JG6 964 aa3.63□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 MSLNLQ96KJ4 702 aa3.63□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 SNX22Q96L94 193 aa3.63□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 USP29Q9HBJ7 922 aa3.63□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 AS3MTQ9HBK9 375 aa3.63□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 PRDM11Q9NQV5 511 aa3.63□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 OBP2AQ9NY56 170 aa3.63□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 STEAP1Q9UHE8 339 aa3.63□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa3.63□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 SNX13Q9Y5W8 968 aa3.63□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 A8MVJ9 347 aa3.63□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 CLIC1O00299 241 aa3.63□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 CA12O43570 354 aa3.63□□□□□ -1.83
GPBP1-201ENST00000264779 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.6 ms