RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253024.9

TRIM28-201, Transcript of tripartite motif containing 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM28, Length 2,960 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28-201ENST00000253024 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
TRIM28-201ENST00000253024 CHI3L2Q15782 390 aa22.16■■□□□ 1.14
TRIM28-201ENST00000253024 EP400NLQ6ZTU2 488 aa22.16■■□□□ 1.14
TRIM28-201ENST00000253024 RIOX2Q8IUF8 465 aa22.16■■□□□ 1.14
TRIM28-201ENST00000253024 MCUR1Q96AQ8 359 aa22.16■■□□□ 1.14
TRIM28-201ENST00000253024 FZD8Q9H461 694 aa22.16■■□□□ 1.14
TRIM28-201ENST00000253024 ETNK2Q9NVF9 386 aa22.16■■□□□ 1.14
TRIM28-201ENST00000253024 SENP1Q9P0U3 644 aa22.16■■□□□ 1.14
TRIM28-201ENST00000253024 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
TRIM28-201ENST00000253024 MEI4A8MW99 385 aa22.15■■□□□ 1.14
TRIM28-201ENST00000253024 ADORA2AP29274 412 aa22.15■■□□□ 1.14
TRIM28-201ENST00000253024 SERPINB4P48594 390 aa22.15■■□□□ 1.14
TRIM28-201ENST00000253024 AP3M2P53677 418 aa22.15■■□□□ 1.14
TRIM28-201ENST00000253024 CEP128Q6ZU80 1094 aa22.15■■□□□ 1.14
TRIM28-201ENST00000253024 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa22.15■■□□□ 1.14
TRIM28-201ENST00000253024 AGR3Q8TD06 166 aa22.15■■□□□ 1.14
TRIM28-201ENST00000253024 FGD4Q96M96 766 aa22.15■■□□□ 1.14
TRIM28-201ENST00000253024 RSAD1Q9HA92 442 aa22.15■■□□□ 1.14
TRIM28-201ENST00000253024 GPRC5DQ9NZD1 345 aa22.15■■□□□ 1.14
TRIM28-201ENST00000253024 MAGEB2O15479 319 aa22.15■■□□□ 1.14
TRIM28-201ENST00000253024 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
TRIM28-201ENST00000253024 PGGT1BP53609 377 aa22.15■■□□□ 1.14
TRIM28-201ENST00000253024 WDR60Q8WVS4 1066 aa22.15■■□□□ 1.14
TRIM28-201ENST00000253024 SPDL1Q96EA4 605 aa22.15■■□□□ 1.14
TRIM28-201ENST00000253024 RNF157Q96PX1 679 aa22.15■■□□□ 1.14
TRIM28-201ENST00000253024 DPP3Q9NY33 737 aa22.15■■□□□ 1.14
TRIM28-201ENST00000253024 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
TRIM28-201ENST00000253024 SSC5DA1L4H1 1573 aa22.15■■□□□ 1.14
TRIM28-201ENST00000253024 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM28-201ENST00000253024 H3BRJ5 948 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM28-201ENST00000253024 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
TRIM28-201ENST00000253024 IL4RP24394 825 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM28-201ENST00000253024 AKAP5P24588 427 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM28-201ENST00000253024 ABCD1P33897 745 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM28-201ENST00000253024 BAG6P46379 1132 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM28-201ENST00000253024 ZNF618Q5T7W0 954 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM28-201ENST00000253024 TTC30AQ86WT1 665 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM28-201ENST00000253024 AFG1LQ8WV93 481 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM28-201ENST00000253024 MOCOSQ96EN8 888 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM28-201ENST00000253024 RILPQ96NA2 401 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM28-201ENST00000253024 C20orf27Q9GZN8 174 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM28-201ENST00000253024 PDZD7Q9H5P4 517 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM28-201ENST00000253024 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM28-201ENST00000253024 SLC5A4Q9NY91 659 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM28-201ENST00000253024 C2CD4BA6NLJ0 364 aa22.14■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 FZD9O00144 591 aa22.14■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 ABL2P42684 1182 aa22.14■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 NOMO1Q15155 1222 aa22.14■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 FAM131BQ86XD5 332 aa22.14■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 TP53INP2Q8IXH6 220 aa22.14■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 PQLC3Q8N755 202 aa22.14■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 EFCAB3Q8N7B9 438 aa22.14■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa22.14■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa22.14■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 TEX264Q9Y6I9 313 aa22.14■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 PPP2R5DQ14738 602 aa22.14■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 RCN1Q15293 331 aa22.14■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 NDUFAF2Q8N183 169 aa22.14■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 FAM149B1Q96BN6 582 aa22.14■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 LGMNQ99538 433 aa22.14■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 USP29Q9HBJ7 922 aa22.14■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 SNTG2Q9NY99 539 aa22.14■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 BST1Q10588 318 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 EML3Q32P44 896 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 FAM167AQ96KS9 214 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 CNPY3Q9BT09 278 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 BCO2Q9BYV7 579 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 KCNK13Q9HB14 408 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 NME7Q9Y5B8 376 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 LCTP09848 1927 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 APOL1O14791 398 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 TPBGLP0DKB5 382 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 OSBPP22059 807 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 PROZP22891 400 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 AMPD1P23109 780 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 SDC4P31431 198 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 SPNS2Q8IVW8 549 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 SLC44A1Q8WWI5 657 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 MCRS1Q96EZ8 462 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 C2orf40Q9H1Z8 148 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 LHX5Q9H2C1 402 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 ZNF408Q9H9D4 720 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 RBPJLQ9UBG7 517 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 C2CD2LO14523 706 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 FCHO1O14526 889 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 USP12O75317 370 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 PFKMP08237 780 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 ADCYAP1R1P41586 468 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 CTC1Q2NKJ3 1217 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 PPP1R36Q96LQ0 422 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 AGAP3Q96P47 875 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM28-201ENST00000253024 EBF4Q9BQW3 602 aa22.12■■□□□ 1.13
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