RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000174113.7

Sumo3-209, Transcript of Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene Sumo3, Length 512 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Cntn5P68500 1098 aa20.3■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ect2Q07139 913 aa20.3■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 NfkbidQ2TB02 327 aa20.3■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Nfe2l2Q60795 597 aa20.3■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Gpr19Q61121 415 aa20.3■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Gpr17Q6NS65 339 aa20.3■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Mib1Q80SY4 1006 aa20.3■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Pum1Q80U78 1189 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Bnc2Q8BMQ3 1127 aa20.3■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ints6lQ8BND4 861 aa20.3■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Slc43a1Q8BSM7 564 aa20.3■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Afap1l1Q8BZI0 768 aa20.3■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Wdr27Q8C5V5 780 aa20.3■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Golph3lQ8R088 285 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Grtp1Q9D3N8 359 aa20.3■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Gtf2h1Q9DBA9 547 aa20.3■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 MesdQ9ERE7 224 aa20.3■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Tjp2Q9Z0U1 1167 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 OtofQ9ESF1 1997 aa20.3■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Zfp990B1AVN5 605 aa20.29■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Gm2897K7N6T7 172 aa20.29■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 CenpcP49452 906 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Sh3bp1P55194 680 aa20.29■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Fermt1P59113 677 aa20.29■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ccdc185Q3V118 621 aa20.29■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Pabpc2Q62029 628 aa20.29■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 ManeaQ6NXH2 462 aa20.29■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Polr3gQ6NXY9 223 aa20.29■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Znf423Q80TS5 1292 aa20.29■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Dnm3Q8BZ98 863 aa20.29■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Slc8a2Q8K596 921 aa20.29■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 AagabQ8R2R3 316 aa20.29■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Luzp1Q8R4U7 1068 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Papd4Q91YI6 484 aa20.29■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Rpl9-ps1S4R1R7 191 aa20.29■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Tex13aA2AFS9 377 aa20.28■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Trim30cD3YVI9 513 aa20.28■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Olfr552E9Q545 317 aa20.28■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Vmn1r55E9Q8I6 310 aa20.28■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Mmp15O54732 657 aa20.28■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Fcer2P20693 331 aa20.28■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Q3TTJ4 293 aa20.28■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Q6PAC4 1279 aa20.28■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ccdc57Q6PHN1 1016 aa20.28■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Tas2r134Q7TQB0 298 aa20.28■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Pym1Q8CHP5 203 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Vmn1r206Q8R277 312 aa20.28■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Slc30a5Q8R4H9 761 aa20.28■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ttc1Q91Z38 292 aa20.28■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 CatsperzQ9CQP8 194 aa20.28■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Sec13Q9D1M0 322 aa20.28■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Rnf14Q9JI90 485 aa20.28■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Asap1Q9QWY8 1147 aa20.28■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Znf354bQ9QXT9 601 aa20.28■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Eif2ak3Q9Z2B5 1114 aa20.28■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Scn8aQ9WTU3 1978 aa20.28■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 4933424G06RikA0A140LIP3 267 aa20.27■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Farp1F8VPU2 1048 aa20.27■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Srsf5O35326 269 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Pde8aO88502 823 aa20.27■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Cd8aP01731 247 aa20.27■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 ZfxP17012 799 aa20.27■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Cdh9P70407 786 aa20.27■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Htr4P97288 388 aa20.27■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Bcl2a1cQ0P538 128 aa20.27■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 DgkqQ6P5E8 934 aa20.27■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Tha1Q6XPS7 400 aa20.27■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 HhipQ7TN16 700 aa20.27■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Olfr1198Q7TR12 308 aa20.27■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Olfr698Q7TRN4 311 aa20.27■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Anks1bQ8BIZ1 1259 aa20.27■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Fam43aQ8BUP8 424 aa20.27■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Cep95Q8BVV7 827 aa20.27■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Slc9b1Q8C0X2 565 aa20.27■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Znf426Q8R1D1 550 aa20.27■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Adgrf1Q8VEC3 908 aa20.27■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Cyp2c55Q9D816 490 aa20.27■□□□□ 0.84
Sumo3-209ENSMUST00000174113 CrebbpP45481 2441 aa20.26■□□□□ 0.83
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Zfp266E9Q2S7 604 aa20.26■□□□□ 0.83
Sumo3-209ENSMUST00000174113 LipiF6YQT7 476 aa20.26■□□□□ 0.83
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Zbtb11G5E8B9 1050 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Pgrmc1O55022 195 aa20.26■□□□□ 0.83
Sumo3-209ENSMUST00000174113 AladP10518 330 aa20.26■□□□□ 0.83
Sumo3-209ENSMUST00000174113 RargP18911 458 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
Sumo3-209ENSMUST00000174113 SlmapQ3URD3 845 aa20.26■□□□□ 0.83
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Cdh7Q8BM92 785 aa20.26■□□□□ 0.83
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Tmem198bQ8CFU0 350 aa20.26■□□□□ 0.83
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Brd3Q8K2F0 726 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Scrn2Q8VCA8 425 aa20.26■□□□□ 0.83
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ubxn4Q8VCH8 506 aa20.26■□□□□ 0.83
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Mark1Q8VHJ5 795 aa20.26■□□□□ 0.83
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Twf1Q91YR1 350 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Sntg2Q925E0 539 aa20.26■□□□□ 0.83
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ndufv2Q9D6J6 248 aa20.26■□□□□ 0.83
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Pdk2Q9JK42 407 aa20.26■□□□□ 0.83
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Hacl1Q9QXE0 581 aa20.26■□□□□ 0.83
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Gvin1Q80SU7 2427 aa20.26■□□□□ 0.83
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ttc17E9PVB5 1198 aa20.25■□□□□ 0.83
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Vmn1r176G3UW31 304 aa20.25■□□□□ 0.83
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Gm5814J3QP80 125 aa20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 42.7 ms