RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027351.12

Ccl20-201, Transcript of C-C motif chemokine 20, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccl20, Length 1,417 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Them5Q9CQJ0 248 aa8.17□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Yeats4Q9CR11 227 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 GarsQ9CZD3 729 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Mgat4dQ9D4R2 373 aa8.17□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Atad1Q9D5T0 361 aa8.17□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tmem86aQ9D8N3 241 aa8.17□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Slc25a19Q9DAM5 318 aa8.17□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 GabrqQ9JLF1 638 aa8.17□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Myl7Q9QVP4 175 aa8.17□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 PigqQ9QYT7 581 aa8.17□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ercc4Q9QZD4 917 aa8.17□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Kcnh3Q9WVJ0 1095 aa8.17□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Mx2Q9WVP9 655 aa8.17□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Spg11Q3UHA3 2430 aa8.17□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ankrd11E9Q4F7 2643 aa8.17□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Pcdh11xF6ZNL5 1338 aa8.16□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tmem238lA0A1B0GS74 79 aa8.16□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 A030005L19RikA0A1Y7VIU2 113 aa8.16□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm21981D3Z6Q6 369 aa8.16□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Pate1E9Q658 125 aa8.16□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 H2-T24F8VQG4 363 aa8.16□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Akr1b1P45376 316 aa8.16□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Upp1P52624 311 aa8.16□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 YwhahP68510 246 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ampd1Q3V1D3 745 aa8.16□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Grhl3Q5FWH3 603 aa8.16□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Usp28Q5I043 1051 aa8.16□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Grik1Q60934 836 aa8.16□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Mysm1Q69Z66 819 aa8.16□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Q6GQV0 436 aa8.16□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Atp1a3Q6PIC6 1013 aa8.16□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 R3hdm2Q80TM6 1044 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Sall4Q8BX22 1067 aa8.16□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 AslQ91YI0 464 aa8.16□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Afg3l1Q920A7 789 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Sfxn1Q99JR1 322 aa8.16□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 St7Q99M96 577 aa8.16□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Polr2dQ9D7M8 142 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tlr2Q9QUN7 784 aa8.16□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tspan3Q9QY33 253 aa8.16□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Dnajc12Q9R022 198 aa8.16□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Insl5Q9WUG6 135 aa8.16□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Noc2lQ9WV70 747 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Spag17Q5S003 2320 aa8.16□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Nup210lQ9D2F7 1881 aa8.16□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 MgaA2AWL7 3003 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Taf1Q80UV9 1891 aa8.15□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ighv11-2A0A075B5R8 117 aa8.15□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Vmn2r76E9Q3F5 853 aa8.15□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm28374F6SG70 93 aa8.15□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Taf4bG5E8Z2 855 aa8.15□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tpd52l1O54818 204 aa8.15□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Folr1P35846 255 aa8.15□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Samsn1P57725 372 aa8.15□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ntsr2P70310 416 aa8.15□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Wbp2P97765 261 aa8.15□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Mtf2Q02395 593 aa8.15□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Sox8Q04886 464 aa8.15□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rgs9bpQ148R9 237 aa8.15□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Itpripl2Q3UV16 535 aa8.15□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Zfp791Q497V9 528 aa8.15□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 SynaQ5G5D5 617 aa8.15□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Sun3Q5SS91 320 aa8.15□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tas2r115Q7M719 310 aa8.15□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Polr2eQ80UW8 210 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Osbpl6Q8BXR9 959 aa8.15□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ccdc169Q8BXX9 214 aa8.15□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Hgh1Q8C3I8 393 aa8.15□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Stbd1Q8C7E7 338 aa8.15□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Spink10Q8CAC8 162 aa8.15□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Nxnl1Q8VC33 217 aa8.15□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Acsf2Q8VCW8 615 aa8.15□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Pcdha2Q91Y17 948 aa8.15□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Slc8b1Q925Q3 585 aa8.15□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Mlf2Q99KX1 247 aa8.15□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Nudt8Q9CR24 210 aa8.15□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Fam133bQ9CVI2 245 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 DlstQ9D2G2 454 aa8.15□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 NckipsdQ9ESJ4 714 aa8.15□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Cog8Q9JJA2 640 aa8.15□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Large1Q9Z1M7 756 aa8.15□□□□□ -1.1
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Auts2A0A087WPF7 1261 aa8.14□□□□□ -1.11
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Atp8b5A3FIN4 1183 aa8.14□□□□□ -1.11
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm10718D3Z1I7 227 aa8.14□□□□□ -1.11
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm281D3Z1Y0 860 aa8.14□□□□□ -1.11
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ces1bD3Z5G7 567 aa8.14□□□□□ -1.11
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Acad12D3Z7X0 555 aa8.14□□□□□ -1.11
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Calhm3J3QMI4 347 aa8.14□□□□□ -1.11
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Usp35M0QWN7 1009 aa8.14□□□□□ -1.11
Ccl20-201ENSMUST00000027351 KlO35082 1014 aa8.14□□□□□ -1.11
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tnfrsf11aO35305 625 aa8.14□□□□□ -1.11
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Pax3P24610 479 aa8.14□□□□□ -1.11
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ccl7Q03366 97 aa8.14□□□□□ -1.11
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Map6d1Q14BB9 191 aa8.14□□□□□ -1.11
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Lrrc47Q505F5 581 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Zfp658Q5PPQ4 887 aa8.14□□□□□ -1.11
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rrp12Q6P5B0 1295 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Olfr1105Q7TR58 312 aa8.14□□□□□ -1.11
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Olfr1080Q7TR67 313 aa8.14□□□□□ -1.11
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Fgd5Q80UZ0 1219 aa8.14□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 13.7 ms