RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C YPR145C-AQ2V2P0 78 aa-0.29□□□□□ -2.46
HDA3YPR179C NCE101Q02820 53 aa-0.3□□□□□ -2.46
HDA3YPR179C PAU23Q07987 124 aa-0.3□□□□□ -2.46
HDA3YPR179C PAU17Q12370 124 aa-0.3□□□□□ -2.46
HDA3YPR179C YDR246W-AQ3E763 66 aa-0.3□□□□□ -2.46
HDA3YPR179C YMR175W-AQ3E766 64 aa-0.3□□□□□ -2.46
HDA3YPR179C YKL018C-AQ3E7A7 99 aa-0.3□□□□□ -2.46
HDA3YPR179C TIM12P32830 109 aa-0.3□□□□□ -2.46
HDA3YPR179C SCP1Q08873 200 aa-0.3□□□□□ -2.46
HDA3YPR179C YOL097W-AQ3E7Y9 61 aa-0.3□□□□□ -2.46
HDA3YPR179C YOR011W-AQ3E807 68 aa-0.3□□□□□ -2.46
HDA3YPR179C YBL039W-BP0C268 59 aa-0.31□□□□□ -2.46
HDA3YPR179C YCR085WP25650 117 aa-0.31□□□□□ -2.46
HDA3YPR179C SPI1P40092 148 aa-0.31□□□□□ -2.46
HDA3YPR179C DDR2P89113 61 aa-0.31□□□□□ -2.46
HDA3YPR179C ZEO1Q08245 113 aa-0.31□□□□□ -2.46
HDA3YPR179C YPR108W-AQ3E7B3 70 aa-0.32□□□□□ -2.46
HDA3YPR179C YBR032WP38223 100 aa-0.32□□□□□ -2.46
HDA3YPR179C YJL133C-AQ3E7A3 74 aa-0.32□□□□□ -2.46
HDA3YPR179C YOR008C-AQ3E7B9 74 aa-0.32□□□□□ -2.46
HDA3YPR179C POC4Q12245 148 aaPredicted RBP-0.34□□□□□ -2.46
HDA3YPR179C YKL023C-AQ2V2P3 75 aa-0.34□□□□□ -2.46
HDA3YPR179C YKL068W-AQ3E826 78 aa-0.34□□□□□ -2.46
HDA3YPR179C YIL156W-BQ2V2P4 73 aa-0.34□□□□□ -2.46
HDA3YPR179C NOP10Q6Q547 58 aaPredicted RBP-0.34□□□□□ -2.46
HDA3YPR179C COX9P07255 59 aa-0.35□□□□□ -2.47
HDA3YPR179C OLI1P61829 76 aa-0.35□□□□□ -2.47
HDA3YPR179C ATP17Q06405 101 aa-0.36□□□□□ -2.47
HDA3YPR179C YOL131WQ08270 108 aa-0.36□□□□□ -2.47
HDA3YPR179C YOR316C-AQ3E806 69 aa-0.36□□□□□ -2.47
HDA3YPR179C YOR394C-AQ8TGJ0 55 aa-0.36□□□□□ -2.47
HDA3YPR179C TOS6P48560 102 aa-0.36□□□□□ -2.47
HDA3YPR179C YDR182W-AQ3E796 67 aa-0.36□□□□□ -2.47
HDA3YPR179C YLL006W-AQ3E814 58 aa-0.36□□□□□ -2.47
HDA3YPR179C YJL127C-BQ3E828 52 aa-0.36□□□□□ -2.47
HDA3YPR179C YCL001W-BQ96VH2 84 aa-0.36□□□□□ -2.47
HDA3YPR179C YPL225WQ08971 146 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
HDA3YPR179C RPS30AP0CX33 63 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
HDA3YPR179C RPS30BP0CX34 63 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
HDA3YPR179C YBR230W-AQ3E762 66 aa-0.37□□□□□ -2.47
HDA3YPR179C YBR200W-AQ3E755 54 aa-0.38□□□□□ -2.47
HDA3YPR179C YGL194C-AQ2V2P6 80 aa-0.39□□□□□ -2.47
HDA3YPR179C YLR342W-AQ3E810 57 aa-0.39□□□□□ -2.47
HDA3YPR179C SMX2P40204 77 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
HDA3YPR179C YGR146C-AQ8TGT9 53 aa-0.41□□□□□ -2.47
HDA3YPR179C SWM2P40342 146 aa-0.41□□□□□ -2.48
HDA3YPR179C YKL065W-AQ2V2P2 73 aa-0.41□□□□□ -2.48
HDA3YPR179C YOR105WQ08504 108 aa-0.43□□□□□ -2.48
HDA3YPR179C LSM2P38203 95 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
HDA3YPR179C PAU7P39545 55 aa-0.45□□□□□ -2.48
HDA3YPR179C YDL022C-AP0C5L6 82 aa-0.46□□□□□ -2.48
HDA3YPR179C QCR9P22289 66 aa-0.46□□□□□ -2.48
HDA3YPR179C YHR213W-AQ8TGT4 77 aa-0.48□□□□□ -2.49
HDA3YPR179C HUB1Q6Q546 73 aa-0.48□□□□□ -2.49
HDA3YPR179C YOR314WQ12506 109 aa-0.49□□□□□ -2.49
HDA3YPR179C YFL041W-AQ3E817 63 aa-0.5□□□□□ -2.49
HDA3YPR179C YLR146W-AQ2V2P1 62 aa-0.51□□□□□ -2.49
HDA3YPR179C YSY6P38374 65 aa-0.57□□□□□ -2.5
HDA3YPR179C PAI3P01094 68 aa-0.59□□□□□ -2.5
HDA3YPR179C SSS1P35179 80 aa-0.59□□□□□ -2.5
HDA3YPR179C YOL166W-AQ8TGJ1 51 aa-0.62□□□□□ -2.51
HDA3YPR179C YIL102C-AQ2V2P5 75 aa-0.65□□□□□ -2.51
HDA3YPR179C VMA9Q3E7B6 73 aa-0.68□□□□□ -2.52
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