RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	NPHS2	Q9NP85	383 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	CHKB	Q9Y259	395 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	NME7	Q9Y5B8	376 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	KAT6A	Q92794	2004 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	FAM155B	O75949	473 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	PTK7	Q13308	1070 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	SNAPC2	Q13487	334 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	SETDB1	Q15047	1291 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	CYTH2	Q99418	400 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152		F5H423	210 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	ENDOD1	O94919	500 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	ZBED1	O96006	694 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	SESTD1	Q86VW0	696 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	PQLC3	Q8N755	202 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	USP29	Q9HBJ7	922 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	MT-ND3	P03897	115 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	INHBA	P08476	426 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	AKAP5	P24588	427 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	ADORA2B	P29275	332 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	FAAP100	Q0VG06	881 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	DPP9	Q86TI2	863 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	SERAC1	Q96JX3	654 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	OSMR	Q99650	979 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	PPCS	Q9HAB8	311 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	HESX1	Q9UBX0	185 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	HAO1	Q9UJM8	370 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152		A8MXQ7	604 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	APOL1	O14791	398 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	GABBR2	O75899	941 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	ZWINT	O95229	277 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	NEFH	P12036	1026 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC130	P13994	396 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	ACVR2B	Q13705	512 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	KCNJ11	Q14654	390 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	MZB1	Q8WU39	189 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	KLK14	Q9P0G3	267 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	SCN1A	P35498	2009 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	PDHX	O00330	501 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	LPXN	O60711	386 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	UNC5C	O95185	931 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	LCP1	P13796	627 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	SMPD1	P17405	629 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	SLC18A1	P54219	525 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	HDAC4	P56524	1084 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	SLC6A3	Q01959	620 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	BOLA3	Q53S33	107 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	PPM1N	Q8N819	430 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	BANP	Q8N9N5	519 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	NETO2	Q8NC67	525 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	PTPRN2	Q92932	1015 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	PYGB	P11216	843 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	GRM5	P41594	1212 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	CCNA1	P78396	465 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	RASA2	Q15283	850 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	TTC17	Q96AE7	1141 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	VTA1	Q9NP79	307 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	CBX6	O95503	412 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	EPHX2	P34913	555 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	GBE1	Q04446	702 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BRF1-222	ENST00000635152	KYAT1	Q16773	422 aa		13.61	□□□□□ -0.23

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