RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	ASB7	Q9H672	318 aa		15.98	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	PREB	Q9HCU5	417 aa		15.98	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	15.98	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	COG5	Q9UP83	839 aa		15.98	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	15.98	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	SESN3	P58005	492 aa		15.98	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	15.98	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	DSG1	Q02413	1049 aa		15.98	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	DEUP1	Q05D60	604 aa		15.98	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		15.98	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	HIC1	Q14526	733 aa		15.98	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF699	Q32M78	642 aa		15.98	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		15.98	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		15.98	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		15.98	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		15.98	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	CCNJL	Q8IV13	435 aa		15.98	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		15.98	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		15.98	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		15.98	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		15.98	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		15.98	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	CYP1A2	P05177	515 aa		15.97	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	NFIC	P08651	508 aa		15.97	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	ABHD2	P08910	425 aa		15.97	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	15.97	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	15.97	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	FOXN2	P32314	431 aa		15.97	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	SULT2A1	Q06520	285 aa		15.97	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	MPP2	Q14168	576 aa		15.97	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		15.97	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		15.97	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	CCDC25	Q86WR0	208 aa		15.97	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		15.97	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	BBOF1	Q8ND07	529 aa		15.97	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		15.97	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		15.97	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		15.97	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		15.97	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		15.97	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	GABRQ	Q9UN88	632 aa		15.97	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	GINS2	Q9Y248	185 aa		15.97	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		15.96	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	THAP12	O43422	761 aa		15.96	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	KPNA6	O60684	536 aa		15.96	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	PFDN1	O60925	122 aa		15.96	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	MTA2	O94776	668 aa		15.96	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	ACSL3	O95573	720 aa		15.96	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	15.96	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	CYBA	P13498	195 aa		15.96	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	GNA15	P30679	374 aa		15.96	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	CD151	P48509	253 aa		15.96	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	CLCN2	P51788	898 aa		15.96	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	15.96	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	TMED1	Q13445	227 aa		15.96	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	15.96	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	15.96	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	JADE1	Q6IE81	842 aa		15.96	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		15.96	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		15.96	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	15.96	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	NRG4	Q8WWG1	115 aa		15.96	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF653	Q96CK0	615 aa		15.96	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	TTC25	Q96NG3	672 aa		15.96	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	ACAP3	Q96P50	834 aa		15.96	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	CATSPER2	Q96P56	530 aa		15.96	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	SMC6	Q96SB8	1091 aa		15.96	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		15.96	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	LRRC19	Q9H756	370 aa		15.96	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	TREH	O43280	583 aa		15.96	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	ASL	P04424	464 aa		15.96	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	15.96	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	15.96	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	CREB1	P16220	341 aa		15.96	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	YY1	P25490	414 aa		15.96	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	GRM5	P41594	1212 aa		15.96	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF132	P52740	706 aa		15.96	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		15.96	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		15.96	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		15.96	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	15.96	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		15.96	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		15.96	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	TRIB2	Q92519	343 aa		15.96	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	ALG3	Q92685	438 aa		15.96	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	SNF8	Q96H20	258 aa		15.96	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	OSMR	Q99650	979 aa		15.96	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		15.96	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	SIX4	Q9UIU6	781 aa		15.96	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	KRT19	P08727	400 aa		15.95	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	15.95	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	FLT3LG	P49771	235 aa		15.95	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	GJA9	P57773	515 aa		15.95	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	15.95	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	15.95	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	NOG	Q13253	232 aa		15.95	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		15.95	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		15.95	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	TTC27	Q6P3X3	843 aa		15.95	■□□□□ 0.14
BBS1-225	ENST00000630659	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		15.95	■□□□□ 0.14

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