RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620854.4

NEDD9-216, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 9, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NEDD9, Length 4,086 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9-216ENST00000620854 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 GMPRP36959 345 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 NOMO3P69849 1222 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 CDC16Q13042 620 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 TRIP10Q15642 601 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 CCL15Q16663 113 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 TKFCQ3LXA3 575 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 TBC1D25Q3MII6 688 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 ZNF276Q8N554 614 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 ZNF606Q8WXB4 792 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 HIC2Q96JB3 615 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 VPS11Q9H270 941 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 PREBQ9HCU5 417 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 PARVAQ9NVD7 372 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 SLC9A2Q9UBY0 812 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 SLC24A2Q9UI40 661 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 HEY1Q9Y5J3 304 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 SLC26A4O43511 780 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 PFDN1O60925 122 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 RBP3P10745 1247 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 PSMA2P25787 234 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 SFNP31947 248 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 MED21Q13503 144 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 EML3Q32P44 896 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 TFDP3Q5H9I0 405 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 C1orf228Q6PIY5 440 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 PAOXQ6QHF9 649 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 TMPRSS6Q8IU80 811 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 EXOC8Q8IYI6 725 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 ABRAQ8N0Z2 381 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 CDKL2Q92772 493 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 TMEM143Q96AN5 459 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 NLRP4Q96MN2 994 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 GCNAQ96QF7 691 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 MED10Q9BTT4 135 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 C20orf27Q9GZN8 174 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 ZNF212Q9UDV6 495 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 ATRNL1Q5VV63 1379 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 UBE4BO95155 1302 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 PTPRJQ12913 1337 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 PROCP04070 461 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 NR3C2P08235 984 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 ITKQ08881 620 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 DLG1Q12959 904 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 MMRN1Q13201 1228 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 NCOA4Q13772 614 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 Q3C1V9 767 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 LIN52Q52LA3 116 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 EFHC2Q5JST6 749 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 ADGRD1Q6QNK2 874 aa7.22□□□□□ -1.25
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NEDD9-216ENST00000620854 GPD1LQ8N335 351 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 TMEM130Q8N3G9 435 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 RNF148Q8N7C7 305 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 OR5B17Q8NGF7 314 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 SKA1Q96BD8 255 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 TRIM11Q96F44 468 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 SPATA16Q9BXB7 569 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 KCND2Q9NZV8 630 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 PDP2Q9P2J9 529 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 GABBR1Q9UBS5 961 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 IP6K2Q9UHH9 426 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 AKT3Q9Y243 479 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 NUB1Q9Y5A7 615 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 CEP350Q5VT06 3117 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 CREB3O43889 395 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 GRAP2O75791 330 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 APRTP07741 180 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 F7P08709 466 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 PEX2P28328 305 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 AQP4P55087 323 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 TTLL4Q14679 1199 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 TCEAL1Q15170 157 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 IYDQ6PHW0 289 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 HACE1Q8IYU2 909 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 NDUFAF2Q8N183 169 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 NLGN2Q8NFZ4 835 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 SPATA18Q8TC71 538 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 DCAKDQ8WVC6 231 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 E2F7Q96AV8 911 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 OPTNQ96CV9 577 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 TAAR1Q96RJ0 339 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 SYT17Q9BSW7 474 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 PHACTR1Q9C0D0 580 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 TLE6Q9H808 572 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD9-216ENST00000620854 RAB6BQ9NRW1 208 aa7.22□□□□□ -1.25
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