RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591760.5

PTPRS-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRS, Length 478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-209ENST00000591760 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
PTPRS-209ENST00000591760 CYP17A1P05093 508 aa27.14■■□□□ 1.94
PTPRS-209ENST00000591760 MARSP56192 900 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
PTPRS-209ENST00000591760 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
PTPRS-209ENST00000591760 CCDC186Q7Z3E2 898 aa27.14■■□□□ 1.94
PTPRS-209ENST00000591760 TRIM59Q8IWR1 403 aa27.14■■□□□ 1.94
PTPRS-209ENST00000591760 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa27.14■■□□□ 1.94
PTPRS-209ENST00000591760 OTUB2Q96DC9 234 aa27.14■■□□□ 1.94
PTPRS-209ENST00000591760 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
PTPRS-209ENST00000591760 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
PTPRS-209ENST00000591760 CFAP54Q96N23 3096 aa27.14■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 RNF40O75150 1001 aa27.13■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 ADH1CP00326 375 aa27.13■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 PGFP49763 221 aa27.13■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 PSEN1P49768 467 aa27.13■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 SGO2Q562F6 1265 aa27.13■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 ANKRD52Q8NB46 1076 aa27.13■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 UBXN6Q9BZV1 441 aa27.13■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 EPC1Q9H2F5 836 aa27.13■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 RWDD2AQ9UIY3 292 aa27.13■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 FAM186AA6NE01 2351 aa27.13■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 K7ESF4 209 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 CCDC192P0DO97 292 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 GOLGA8FQ08AF8 430 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 DHCR24Q15392 516 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 TADA2BQ86TJ2 420 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 UBR7Q8N806 425 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 SUMF1Q8NBK3 374 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 CCDC26Q8TAB7 109 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP27.12■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 USP3Q9Y6I4 520 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 FRYLO94915 3013 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 A0A1W2PQH9 124 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 AFPP02771 609 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 CD19P15391 556 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 BCAT1P54687 386 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 KCNH2Q12809 1159 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 KLHDC10Q6PID8 442 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 PPM1KQ8N3J5 372 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 HINFPQ9BQA5 517 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 NMUR1Q9HB89 426 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP27.11■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 C2orf42Q9NWW7 574 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 OSER1Q9NX31 292 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 HESX1Q9UBX0 185 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 NAGPAQ9UK23 515 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 TSPAN16Q9UKR8 245 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 KIAA1257Q9ULG3 409 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 TBX18O95935 607 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 IRF1P10914 325 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 RARGP13631 454 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 HOXA6P31267 233 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 OPRD1P41143 372 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 PKN3Q6P5Z2 889 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 PIGZQ86VD9 579 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 TTC30AQ86WT1 665 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 RUBCNQ92622 972 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 CLSTN2Q9H4D0 955 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 CLIC5Q9NZA1 410 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 RALAP11233 206 aa27.09■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 VDRP11473 427 aa27.09■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 ADH5P11766 374 aa27.09■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 GAB4Q2WGN9 574 aa27.09■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 RAB41Q5JT25 222 aa27.09■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 RHBDF2Q6PJF5 856 aa27.09■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 TMEM270Q6UE05 265 aa27.09■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 LONP2Q86WA8 852 aa27.09■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 ARHGAP18Q8N392 663 aa27.09■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 MLKLQ8NB16 471 aa27.09■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 LMO3Q8TAP4 145 aa27.09■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 DNMT3LQ9UJW3 386 aa27.09■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 SLC8A2Q9UPR5 921 aa27.09■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 ZNF292O60281 2723 aa27.08■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 PAEPP09466 180 aa27.08■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 FNTBP49356 437 aa27.08■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 GCNT1Q02742 428 aa27.08■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 BST2Q10589 180 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 C10orf120Q5SQS8 335 aa27.08■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 BBS7Q8IWZ6 715 aa27.08■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 ZNF276Q8N554 614 aa27.08■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa27.08■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 ACDQ96AP0 544 aa27.08■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa27.08■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa27.08■■□□□ 1.93
PTPRS-209ENST00000591760 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
PTPRS-209ENST00000591760 CNR2P34972 360 aa27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms