RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 TAS2R40P59535 323 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-204ENST00000587718 ACAP1Q15027 740 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-204ENST00000587718 ZBTB9Q96C00 473 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-204ENST00000587718 TCF25Q9BQ70 676 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-204ENST00000587718 MIS12Q9H081 205 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-204ENST00000587718 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
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CAPNS1-204ENST00000587718 ITGA11Q9UKX5 1188 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-204ENST00000587718 NEU2Q9Y3R4 380 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-204ENST00000587718 C5orf42Q9H799 3197 aa26.67■■□□□ 1.86
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CAPNS1-204ENST00000587718 PPP2R2AP63151 447 aa26.67■■□□□ 1.86
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CAPNS1-204ENST00000587718 C1orf127Q8N9H9 656 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-204ENST00000587718 SIGLEC16A6NMB1 481 aa26.66■■□□□ 1.86
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
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CAPNS1-204ENST00000587718 WDTC1Q8N5D0 677 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-204ENST00000587718 C1orf54Q8WWF1 131 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-204ENST00000587718 CENPTQ96BT3 561 aa26.65■■□□□ 1.86
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CAPNS1-204ENST00000587718 CHST7Q9NS84 486 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-204ENST00000587718 TBC1D13Q9NVG8 400 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM86C2PA6NEL3 165 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-204ENST00000587718 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa26.64■■□□□ 1.86
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CAPNS1-204ENST00000587718 ATF2P15336 505 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-204ENST00000587718 KCNJ1P48048 391 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-204ENST00000587718 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
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CAPNS1-204ENST00000587718 ASIC3Q9UHC3 531 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-204ENST00000587718 GGA2Q9UJY4 613 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1B0GUA9 196 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-204ENST00000587718 RIPK2O43353 540 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-204ENST00000587718 CILPO75339 1184 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-204ENST00000587718 VDRP11473 427 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-204ENST00000587718 GRM5P41594 1212 aa26.63■■□□□ 1.85
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CAPNS1-204ENST00000587718 INCA1Q0VD86 236 aa26.63■■□□□ 1.85
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CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
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CAPNS1-204ENST00000587718 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
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CAPNS1-204ENST00000587718 TSPAN18Q96SJ8 248 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-204ENST00000587718 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa26.63■■□□□ 1.85
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CAPNS1-204ENST00000587718 LLGL2Q6P1M3 1020 aa26.63■■□□□ 1.85
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CAPNS1-204ENST00000587718 PGBD4Q96DM1 585 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-204ENST00000587718 GALTP07902 379 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-204ENST00000587718 KRT7P08729 469 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-204ENST00000587718 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-204ENST00000587718 SUSD6Q92537 303 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM176AQ96HP8 235 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-204ENST00000587718 ACAP3Q96P50 834 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-204ENST00000587718 MCEEQ96PE7 176 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-204ENST00000587718 S1PR5Q9H228 398 aa26.62■■□□□ 1.85
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