RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585291.5

NFE2L1-222, Transcript of nuclear factor, erythroid 2 like 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene NFE2L1, Length 4,390 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFE2L1-222	ENST00000585291	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	CLDN5	O00501	218 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	BANF1	O75531	89 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	HMBS	P08397	361 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	RBL1	P28749	1068 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	PDK1	Q15118	436 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	13.3	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	SPATA21	Q7Z572	469 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	PGM2	Q96G03	612 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	UPP2	O95045	317 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	NUMB	P49757	651 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	TAF5	Q15542	800 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	UNC93A	Q86WB7	457 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	SGSM3	Q96HU1	749 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	ZFAT	Q9P243	1243 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	TLK1	Q9UKI8	766 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	SERPINB6	P35237	376 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	BBS12	Q6ZW61	710 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	WDCP	Q9H6R7	721 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	IPP	Q9Y573	584 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	KPNA6	O60684	536 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	EDN1	P05305	212 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	CD48	P09326	243 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	KIT	P10721	976 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	ELK3	P41970	407 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	FLT3LG	P49771	235 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	ACAP1	Q15027	740 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	CHADL	Q6NUI6	762 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	NETO2	Q8NC67	525 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	ADAM2	Q99965	735 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	TRAPPC3	O43617	180 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	GJA5	P36382	358 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	LHX1	P48742	406 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	PMF1	Q6P1K2	205 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	ALLC	Q8N6M5	410 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	TBCB	Q99426	244 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	SH3GL2	Q99962	352 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	E2F8	A0AVK6	867 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	STMN2	Q93045	179 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	PAFAH2	Q99487	392 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	SIX4	Q9UIU6	781 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		13.28	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	COG7	P83436	770 aa		13.28	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		13.28	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	MROH9	Q5TGP6	573 aa		13.28	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		13.28	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	PPEF2	O14830	753 aa		13.28	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	NUDT17	P0C025	328 aa		13.28	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	TYK2	P29597	1187 aa		13.28	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		13.28	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		13.28	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	LRRC6	Q86X45	466 aa		13.28	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		13.28	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	KCNK1	O00180	336 aa		13.28	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	SMAP	O00193	183 aa		13.28	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	MX2	P20592	715 aa		13.28	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	APOL2	Q9BQE5	337 aa		13.28	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		13.28	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		13.28	□□□□□ -0.28
NFE2L1-222	ENST00000585291	USP17L7	P0C7H9	530 aa		13.27	□□□□□ -0.28

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