RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577435.5

GGA3-203, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 547 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-203ENST00000577435 FANCMQ8IYD8 2048 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-203ENST00000577435 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
GGA3-203ENST00000577435 E2F8A0AVK6 867 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-203ENST00000577435 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
GGA3-203ENST00000577435 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
GGA3-203ENST00000577435 CYP26A1O43174 497 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-203ENST00000577435 TLR5O60602 858 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-203ENST00000577435 ARSAP15289 507 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-203ENST00000577435 SLC9A1P19634 815 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-203ENST00000577435 PON1P27169 355 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-203ENST00000577435 PLA2G4AP47712 749 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-203ENST00000577435 PDE4CQ08493 712 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-203ENST00000577435 BST2Q10589 180 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
GGA3-203ENST00000577435 NR1H3Q13133 447 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-203ENST00000577435 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-203ENST00000577435 DGKKQ5KSL6 1271 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-203ENST00000577435 SCD5Q86SK9 330 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-203ENST00000577435 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-203ENST00000577435 SCML4Q8N228 414 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-203ENST00000577435 SYNPOQ8N3V7 929 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-203ENST00000577435 CPA6Q8N4T0 437 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-203ENST00000577435 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
GGA3-203ENST00000577435 TTC8Q8TAM2 541 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-203ENST00000577435 KCTD13Q8WZ19 329 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-203ENST00000577435 CHFRQ96EP1 664 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-203ENST00000577435 ZSWIM1Q9BR11 485 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-203ENST00000577435 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-203ENST00000577435 CRACR2AQ9BSW2 395 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-203ENST00000577435 NDST4Q9H3R1 872 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-203ENST00000577435 NMUR1Q9HB89 426 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-203ENST00000577435 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
GGA3-203ENST00000577435 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.05
GGA3-203ENST00000577435 OSER1Q9NX31 292 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-203ENST00000577435 SMPD4Q9NXE4 827 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-203ENST00000577435 CLIC5Q9NZA1 410 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-203ENST00000577435 TBC1D14Q9P2M4 693 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-203ENST00000577435 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
GGA3-203ENST00000577435 WNT6Q9Y6F9 365 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-203ENST00000577435 A0A1W2PQH9 124 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 SETSIPP0DME0 302 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 GJA4P35212 333 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 MFAP3P55082 362 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 LRRC32Q14392 662 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 VWA3BQ502W6 1294 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 TMEM196Q5HYL7 178 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 MIIPQ5JXC2 388 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 CCDC183Q5T5S1 534 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 SASS6Q6UVJ0 657 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 TADA2BQ86TJ2 420 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 ARHGAP18Q8N392 663 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 SLC35F5Q8WV83 523 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 OTUB2Q96DC9 234 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 ANO10Q9NW15 660 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 CFAP97Q9P2B7 532 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 APEX2Q9UBZ4 518 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 FBXO4Q9UKT5 387 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 KCNJ18B7U540 433 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 TULP2O00295 520 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 NFATC1O95644 943 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 TBX18O95935 607 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 RALAP11233 206 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 RARGP13631 454 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 NBL1P41271 181 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 TKTL1P51854 596 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 CCINQ13939 588 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 KCNJ12Q14500 433 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 PON2Q15165 354 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 MEA1Q16626 185 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 ZNF528Q3MIS6 628 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 TCP11X2Q5H9J9 407 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 HTR3DQ70Z44 454 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 UBA3Q8TBC4 463 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 EXOC4Q96A65 974 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 HSFY1Q96LI6 401 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 NACA2Q9H009 215 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa14.69□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 PROB1E7EW31 1015 aa14.68□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 LAMTOR5O43504 91 aa14.68□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 GREM1O60565 184 aa14.68□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 ZBED1O96006 694 aa14.68□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 BRD2P25440 801 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 GALK1P51570 392 aa14.68□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 MTAPQ13126 283 aa14.68□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 CDKAL1Q5VV42 579 aa14.68□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 SHC3Q92529 594 aa14.68□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 LRRC4Q9HBW1 653 aa14.68□□□□□ -0.06
GGA3-203ENST00000577435 SIX2Q9NPC8 291 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms