RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 NAGPAQ9UK23 515 aa34.8■■■■□ 3.16
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CKMP06732 381 aa34.79■■■■□ 3.16
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CHRNB2P17787 502 aa34.79■■■■□ 3.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 TANGO2Q6ICL3 276 aa34.79■■■■□ 3.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 SCD5Q86SK9 330 aa34.79■■■■□ 3.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP34.79■■■■□ 3.16
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CYP2S1Q96SQ9 504 aa34.79■■■■□ 3.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLIC5Q9NZA1 410 aa34.79■■■■□ 3.16
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CTDNEP1-209ENST00000574205 BHLHA9Q7RTU4 235 aa34.78■■■■□ 3.16
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CTDNEP1-209ENST00000574205 BDP1A6H8Y1 2624 aa34.77■■■■□ 3.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 E5RJQ4 531 aa34.77■■■■□ 3.16
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CCSER2Q9H7U1 834 aa34.77■■■■□ 3.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 TDP1Q9NUW8 608 aa34.77■■■■□ 3.16
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF276Q8N554 614 aa34.76■■■■□ 3.16
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CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF38Q9H0F5 515 aa34.76■■■■□ 3.16
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP34.76■■■■□ 3.16
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CTDNEP1-209ENST00000574205 DPYSL4O14531 572 aa34.76■■■■□ 3.15
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP34.76■■■■□ 3.15
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CTDNEP1-209ENST00000574205 E7ENQ6 273 aa34.75■■■■□ 3.15
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CTDNEP1-209ENST00000574205 RARGP13631 454 aa34.75■■■■□ 3.15
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TADA2BQ86TJ2 420 aa34.75■■■■□ 3.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC44A3Q8N4M1 653 aa34.75■■■■□ 3.15
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa34.75■■■■□ 3.15
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CTDNEP1-209ENST00000574205 KLHDC10Q6PID8 442 aa34.74■■■■□ 3.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 NACA2Q9H009 215 aa34.74■■■■□ 3.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 HAUS4Q9H6D7 363 aa34.74■■■■□ 3.15
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TJP2Q9UDY2 1190 aa34.74■■■■□ 3.15
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CTDNEP1-209ENST00000574205 VITQ6UXI7 678 aa34.73■■■■□ 3.15
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SYT11Q9BT88 431 aa34.73■■■■□ 3.15
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CTDNEP1-209ENST00000574205 BTBD8Q5XKL5 378 aa34.72■■■■□ 3.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 ERICH1Q86X53 443 aa34.72■■■■□ 3.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa34.72■■■■□ 3.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 CPA5Q8WXQ8 436 aa34.72■■■■□ 3.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 GOLGA1Q92805 767 aa34.72■■■■□ 3.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 RSPRY1Q96DX4 576 aa34.72■■■■□ 3.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP34.72■■■■□ 3.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABCC13Q9NSE7 274 aa34.72■■■■□ 3.15
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