RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564105.5

CTU2-204, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CTU2, Length 1,586 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-204ENST00000564105 EFHC1Q5JVL4 640 aa20.11■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 ITIH5Q86UX2 942 aa20.11■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 RHOT2Q8IXI1 618 aa20.11■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 SLC35G2Q8TBE7 412 aa20.11■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 IRGQQ8WZA9 623 aa20.11■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 EHD2Q9NZN4 543 aa20.11■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 UVRAGQ9P2Y5 699 aa20.11■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 ASB3Q9Y575 518 aa20.11■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 SPDYE4A6NLX3 237 aa20.1■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 SIGLEC16A6NMB1 481 aa20.1■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 USP27XA6NNY8 438 aa20.1■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 BTNL10A8MVZ5 291 aa20.1■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 SART1O43290 800 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 RFPL2O75678 378 aa20.1■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 KRT3P12035 628 aa20.1■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 SCNN1AP37088 669 aa20.1■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 ARHGAP25P42331 645 aa20.1■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 RBM10P98175 930 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 KCNC3Q14003 757 aa20.1■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 SLC26A9Q7LBE3 791 aa20.1■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 ELMOD1Q8N336 334 aa20.1■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 FBXO32Q969P5 355 aa20.1■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 PSMG2Q969U7 264 aa20.1■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 TTLL2Q9BWV7 592 aa20.1■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 OSGEPQ9NPF4 335 aa20.1■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 GUCA1BQ9UMX6 200 aa20.1■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 SCML2Q9UQR0 700 aa20.1■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 MTCH2Q9Y6C9 303 aa20.1■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 FAM92AA1XBS5 289 aa20.09■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 YJEFN3A6XGL0 299 aa20.09■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 E7ENQ6 273 aa20.09■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 GRAP2O75791 330 aa20.09■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 NOP2P46087 812 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 HYAL1Q12794 435 aa20.09■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 TAF5Q15542 800 aa20.09■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa20.09■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 DCUN1D2Q6PH85 259 aa20.09■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 BHLHA9Q7RTU4 235 aa20.09■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 FEZF2Q8TBJ5 459 aa20.09■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 FAM149B1Q96BN6 582 aa20.09■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 KCND1Q9NSA2 647 aa20.09■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 SALL4Q9UJQ4 1053 aa20.09■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 COG5Q9UP83 839 aa20.09■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 NCOR1O75376 2440 aa20.09■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 CCL16O15467 120 aa20.08■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 HOXA9P31269 272 aa20.08■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 TAF10Q12962 218 aa20.08■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 TCEAL1Q15170 157 aa20.08■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 HFE2Q6ZVN8 426 aa20.08■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 VN1R2Q8NFZ6 395 aa20.08■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 JOSD2Q8TAC2 188 aa20.08■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 CASP10Q92851 521 aa20.08■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 MYRFLQ96LU7 910 aa20.08■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 MCEEQ96PE7 176 aa20.08■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 SLITRK1Q96PX8 696 aa20.08■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 ASNSD1Q9NWL6 643 aa20.08■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa20.08■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 TMEM59LQ9UK28 342 aa20.08■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 DOCK8Q8NF50 2099 aa20.08■□□□□ 0.81
CTU2-204ENST00000564105 MACROD2A1Z1Q3 448 aa20.08■□□□□ 0.8
CTU2-204ENST00000564105 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa20.08■□□□□ 0.8
CTU2-204ENST00000564105 BUB1O43683 1085 aa20.08■□□□□ 0.8
CTU2-204ENST00000564105 HSF2BPO75031 334 aa20.08■□□□□ 0.8
CTU2-204ENST00000564105 LTFP02788 710 aa20.08■□□□□ 0.8
CTU2-204ENST00000564105 GLI1P08151 1106 aa20.08■□□□□ 0.8
CTU2-204ENST00000564105 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
CTU2-204ENST00000564105 MON1AQ86VX9 555 aa20.08■□□□□ 0.8
CTU2-204ENST00000564105 MICALL1Q8N3F8 863 aa20.08■□□□□ 0.8
CTU2-204ENST00000564105 EFHBQ8N7U6 833 aa20.08■□□□□ 0.8
CTU2-204ENST00000564105 GOLGA1Q92805 767 aa20.08■□□□□ 0.8
CTU2-204ENST00000564105 GMIPQ9P107 970 aa20.08■□□□□ 0.8
CTU2-204ENST00000564105 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
CTU2-204ENST00000564105 MTA2O94776 668 aa20.07■□□□□ 0.8
CTU2-204ENST00000564105 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CTU2-204ENST00000564105 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP20.07■□□□□ 0.8
CTU2-204ENST00000564105 TJAP1Q5JTD0 557 aa20.07■□□□□ 0.8
CTU2-204ENST00000564105 ZSCAN30Q86W11 494 aa20.07■□□□□ 0.8
CTU2-204ENST00000564105 EMC1Q8N766 993 aa20.07■□□□□ 0.8
CTU2-204ENST00000564105 POPDC2Q9HBU9 364 aa20.07■□□□□ 0.8
CTU2-204ENST00000564105 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CTU2-204ENST00000564105 DZANK1Q9NVP4 752 aa20.07■□□□□ 0.8
CTU2-204ENST00000564105 THEGQ9P2T0 379 aa20.07■□□□□ 0.8
CTU2-204ENST00000564105 ANAPC7Q9UJX3 599 aa20.07■□□□□ 0.8
CTU2-204ENST00000564105 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa20.07■□□□□ 0.8
CTU2-204ENST00000564105 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa20.06■□□□□ 0.8
CTU2-204ENST00000564105 A0A1W2PQH9 124 aa20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms