RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563952.1

CMTM4-204, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 1,023 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-204ENST00000563952 TBX18O95935 607 aa32.38■■■□□ 2.77
CMTM4-204ENST00000563952 IRF1P10914 325 aa32.38■■■□□ 2.77
CMTM4-204ENST00000563952 GAS6Q14393 721 aa32.38■■■□□ 2.77
CMTM4-204ENST00000563952 TMEM196Q5HYL7 178 aa32.38■■■□□ 2.77
CMTM4-204ENST00000563952 FSTL4Q6MZW2 842 aa32.38■■■□□ 2.77
CMTM4-204ENST00000563952 CCDC186Q7Z3E2 898 aa32.38■■■□□ 2.77
CMTM4-204ENST00000563952 IRF2BP1Q8IU81 584 aa32.38■■■□□ 2.77
CMTM4-204ENST00000563952 GPT2Q8TD30 523 aa32.38■■■□□ 2.77
CMTM4-204ENST00000563952 P2RY13Q9BPV8 354 aa32.38■■■□□ 2.77
CMTM4-204ENST00000563952 UBXN6Q9BZV1 441 aa32.38■■■□□ 2.77
CMTM4-204ENST00000563952 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP32.38■■■□□ 2.77
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CMTM4-204ENST00000563952 RARGP13631 454 aa32.37■■■□□ 2.77
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CMTM4-204ENST00000563952 ZNF528Q3MIS6 628 aa32.37■■■□□ 2.77
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CMTM4-204ENST00000563952 UBA3Q8TBC4 463 aa32.37■■■□□ 2.77
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CMTM4-204ENST00000563952 CYLDQ9NQC7 956 aa32.37■■■□□ 2.77
CMTM4-204ENST00000563952 NUDT5Q9UKK9 219 aa32.37■■■□□ 2.77
CMTM4-204ENST00000563952 USP3Q9Y6I4 520 aa32.37■■■□□ 2.77
CMTM4-204ENST00000563952 E2F8A0AVK6 867 aa32.36■■■□□ 2.77
CMTM4-204ENST00000563952 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP32.36■■■□□ 2.77
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CMTM4-204ENST00000563952 BST2Q10589 180 aaKnown RBP32.36■■■□□ 2.77
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CMTM4-204ENST00000563952 SPEM1Q8N4L4 309 aa32.36■■■□□ 2.77
CMTM4-204ENST00000563952 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP32.36■■■□□ 2.77
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CMTM4-204ENST00000563952 EXOC4Q96A65 974 aa32.36■■■□□ 2.77
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CMTM4-204ENST00000563952 EGFP01133 1207 aa32.35■■■□□ 2.77
CMTM4-204ENST00000563952 CYP17A1P05093 508 aa32.35■■■□□ 2.77
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CMTM4-204ENST00000563952 C10orf120Q5SQS8 335 aa32.35■■■□□ 2.77
CMTM4-204ENST00000563952 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa32.35■■■□□ 2.77
CMTM4-204ENST00000563952 SYNPOQ8N3V7 929 aa32.35■■■□□ 2.77
CMTM4-204ENST00000563952 CD101Q93033 1021 aa32.35■■■□□ 2.77
CMTM4-204ENST00000563952 KREMEN1Q96MU8 473 aa32.35■■■□□ 2.77
CMTM4-204ENST00000563952 THAP9Q9H5L6 903 aa32.35■■■□□ 2.77
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CMTM4-204ENST00000563952 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP32.35■■■□□ 2.77
CMTM4-204ENST00000563952 TBC1D14Q9P2M4 693 aa32.35■■■□□ 2.77
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CMTM4-204ENST00000563952 CXCL12P48061 93 aa32.34■■■□□ 2.77
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CMTM4-204ENST00000563952 TKTL1P51854 596 aa32.34■■■□□ 2.77
CMTM4-204ENST00000563952 PPP2R5DQ14738 602 aa32.34■■■□□ 2.77
CMTM4-204ENST00000563952 DHCR24Q15392 516 aa32.34■■■□□ 2.77
CMTM4-204ENST00000563952 RAB41Q5JT25 222 aa32.34■■■□□ 2.77
CMTM4-204ENST00000563952 MAMSTRQ6ZN01 415 aa32.34■■■□□ 2.77
CMTM4-204ENST00000563952 ASCL5Q7RTU5 278 aa32.34■■■□□ 2.77
CMTM4-204ENST00000563952 WBP2Q969T9 261 aa32.34■■■□□ 2.77
CMTM4-204ENST00000563952 RALAP11233 206 aa32.33■■■□□ 2.77
CMTM4-204ENST00000563952 BRD2P25440 801 aaKnown RBP32.33■■■□□ 2.77
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CMTM4-204ENST00000563952 FAM114A1Q8IWE2 563 aa32.33■■■□□ 2.77
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CMTM4-204ENST00000563952 PRR23AA6NEV1 266 aa32.32■■■□□ 2.76
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CMTM4-204ENST00000563952 DRD1P21728 446 aa32.32■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 GOLGA8FQ08AF8 430 aa32.32■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa32.32■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 LCLAT1Q6UWP7 414 aa32.32■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 GBP6Q6ZN66 633 aa32.32■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 TADA2BQ86TJ2 420 aa32.32■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 BBS7Q8IWZ6 715 aa32.32■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 DNMT3LQ9UJW3 386 aa32.32■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 PIEZO1Q92508 2521 aa32.32■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 FANCMQ8IYD8 2048 aa32.31■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 SETSIPP0DME0 302 aa32.31■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 SLC9A1P19634 815 aa32.31■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 TRIM65Q6PJ69 517 aa32.31■■■□□ 2.76
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CMTM4-204ENST00000563952 ZSCAN32Q9NX65 697 aa32.31■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 CLIC5Q9NZA1 410 aa32.31■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 M0QYV0 167 aa32.3■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 ZBED1O96006 694 aa32.3■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 ADH1CP00326 375 aa32.3■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 PLA2G4AP47712 749 aa32.3■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 ZNF132P52740 706 aa32.3■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 ADIGQ0VDE8 80 aa32.3■■■□□ 2.76
CMTM4-204ENST00000563952 GJB7Q6PEY0 223 aa32.3■■■□□ 2.76
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