RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	CYP17A1	P05093	508 aa		22.99	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	KIF11	P52732	1056 aa		22.99	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	CUL2	Q13617	745 aa		22.99	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		22.99	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	RUBCN	Q92622	972 aa		22.99	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		22.99	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	22.99	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	USP3	Q9Y6I4	520 aa		22.99	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	BIN1	O00499	593 aa		22.98	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	CYP26A1	O43174	497 aa		22.98	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF40	O75150	1001 aa		22.98	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	22.98	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	FMO5	P49326	533 aa		22.98	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	UBE2H	P62256	183 aa		22.98	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	DHCR24	Q15392	516 aa		22.98	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	FBXO43	Q4G163	708 aa		22.98	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		22.98	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		22.98	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	UBR7	Q8N806	425 aa		22.98	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	EXOC4	Q96A65	974 aa		22.98	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		22.98	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		22.98	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	22.98	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	ATG13	O75143	517 aa		22.97	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	FNTB	P49356	437 aa		22.97	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	WBP2	Q969T9	261 aa		22.97	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	NMUR1	Q9HB89	426 aa		22.97	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		22.97	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	BICDL2	A1A5D9	508 aa		22.96	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	GREM1	O60565	184 aa		22.96	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	TBX18	O95935	607 aa		22.96	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		22.96	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	LONP2	Q86WA8	852 aa		22.96	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	DCLK2	Q8N568	766 aa		22.96	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	LMO3	Q8TAP4	145 aa		22.96	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	OTUB2	Q96DC9	234 aa		22.96	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		22.96	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		22.96	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	CACNA1A	O00555	2505 aa		22.95	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	HR	O43593	1189 aa		22.95	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	22.95	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		22.95	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		22.95	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	SCD5	Q86SK9	330 aa		22.95	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF276	Q8N554	614 aa		22.95	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		22.95	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		22.95	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	22.95	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	22.95	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	22.95	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1W2PQH9	124 aa		22.94	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	STX17	P56962	302 aa		22.94	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	MESP2	Q0VG99	397 aa		22.94	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	LRMP	Q12912	555 aa		22.94	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	PAK1	Q13153	545 aa		22.94	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB41	Q5JT25	222 aa		22.94	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	TTC30A	Q86WT1	665 aa		22.94	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		22.94	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		22.94	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		22.94	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		22.93	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		22.93	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200		K7EQS6	105 aa		22.93	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	P4HA2	O15460	535 aa		22.93	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	ADH1C	P00326	375 aa		22.93	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	22.93	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	CNR2	P34972	360 aa		22.93	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	22.93	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	22.93	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	22.93	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	HTR3D	Q70Z44	454 aa		22.93	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	PIGZ	Q86VD9	579 aa		22.93	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		22.93	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	C12orf40	Q86WS4	652 aa		22.93	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		22.93	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	NACA2	Q9H009	215 aa		22.93	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		22.93	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	EML5	Q05BV3	1969 aa		22.93	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A0A0MRY4	1105 aa		22.92	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		22.92	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	22.92	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	RARG	P13631	454 aa		22.92	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC6A11	P48066	632 aa		22.92	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	PSEN1	P49768	467 aa		22.92	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	22.92	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	CAMK4	Q16566	473 aa		22.92	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		22.92	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	SYT13	Q7L8C5	426 aa		22.92	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		22.92	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	22.91	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	ANTXRL	A6NF34	631 aa		22.91	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	GNA14	O95837	355 aa		22.91	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	ADH5	P11766	374 aa		22.91	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	22.91	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		22.91	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	USP33	Q8TEY7	942 aa		22.91	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	NT5C1B	Q96P26	610 aa		22.91	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	MED15	Q96RN5	788 aa		22.91	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	HINFP	Q9BQA5	517 aa		22.91	■■□□□ 1.26
PPP4C-205	ENST00000563200	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	22.91	■■□□□ 1.26

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