RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562866.1

VPS9D1-AS1-202, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS9D1-AS1, Length 1,753 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SPC25Q9HBM1 224 aa22.25■■□□□ 1.15
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 UBN1Q9NPG3 1134 aa22.25■■□□□ 1.15
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EURLQ9NYK6 297 aa22.25■■□□□ 1.15
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HDAC4P56524 1084 aa22.25■■□□□ 1.15
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SEC16BQ96JE7 1060 aa22.25■■□□□ 1.15
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CHST12Q9NRB3 414 aa22.25■■□□□ 1.15
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C4orf22Q6V702 233 aa22.24■■□□□ 1.15
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 OTUD6BQ8N6M0 293 aa22.24■■□□□ 1.15
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa22.24■■□□□ 1.15
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SENP1Q9P0U3 644 aa22.24■■□□□ 1.15
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CYB561D2O14569 222 aa22.23■■□□□ 1.15
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FCGRTP55899 365 aa22.22■■□□□ 1.15
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NBPF20Q3BBV1 942 aa22.22■■□□□ 1.15
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PCDH19Q8TAB3 1148 aa22.22■■□□□ 1.15
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa22.22■■□□□ 1.15
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZBED1O96006 694 aa22.21■■□□□ 1.15
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CA9Q16790 459 aa22.21■■□□□ 1.15
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KLHL38Q2WGJ6 581 aa22.21■■□□□ 1.15
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ANKMY2Q8IV38 441 aa22.21■■□□□ 1.15
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TMEM86AQ8N2M4 240 aa22.21■■□□□ 1.15
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CLEC4CQ8WTT0 213 aa22.21■■□□□ 1.15
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KCTD13Q8WZ19 329 aa22.21■■□□□ 1.15
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa22.21■■□□□ 1.15
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 USP29Q9HBJ7 922 aa22.21■■□□□ 1.15
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa22.2■■□□□ 1.14
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