RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559642.1

BMP4-208, Transcript of bone morphogenetic protein 4, human

TSL 3

Gene BMP4, Length 505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BMP4-208	ENST00000559642	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	UBA3	Q8TBC4	463 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	THAP9	Q9H5L6	903 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	DACH1	Q9UI36	760 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	NAGPA	Q9UK23	515 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642		R4GN57	208 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	NFATC1	O95644	943 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	CYP17A1	P05093	508 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	PAEP	P09466	180 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	VDR	P11473	427 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	SLC9A1	P19634	815 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	NBL1	P41271	181 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	GCNT1	Q02742	428 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	CCIN	Q13939	588 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	SCD5	Q86SK9	330 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	13.58	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	CYLD	Q9NQC7	956 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	13.58	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	HESX1	Q9UBX0	185 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	USP3	Q9Y6I4	520 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	CACNA1H	O95180	2353 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642		M0QYV0	167 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	EGF	P01133	1207 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	RARG	P13631	454 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	KRT5	P13647	590 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	TKTL1	P51854	596 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	ZNF132	P52740	706 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	SLC8A3	P57103	927 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	SATB1	Q01826	763 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	ADIG	Q0VDE8	80 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	MAN2A1	Q16706	1144 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	GAB4	Q2WGN9	574 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	RAB41	Q5JT25	222 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	13.57	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	E2F8	A0AVK6	867 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	PIK3R2	O00459	728 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	SETSIP	P0DME0	302 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	HOXC13	P31276	330 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	RGS7	P49802	495 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	GALK1	P51570	392 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	PKDCC	Q504Y2	493 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	GBP6	Q6ZN66	633 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	CD101	Q93033	1021 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	ACP6	Q9NPH0	428 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	KCNJ18	B7U540	433 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	PROB1	E7EW31	1015 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	GFRA3	O60609	400 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	MBD3	O95983	291 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	RALA	P11233	206 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	LCP1	P13796	627 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	PON1	P27169	355 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	OPRD1	P41143	372 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	PLA2G4A	P47712	749 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	13.55	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	AMPD2	Q01433	879 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	NR1H3	Q13133	447 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	KCNJ12	Q14500	433 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BMP4-208	ENST00000559642	DHCR24	Q15392	516 aa		13.55	□□□□□ -0.24

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