RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559282.1

BLM-204, Transcript of Bloom syndrome RecQ like helicase, human

TSL 3

Gene BLM, Length 866 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BLM-204	ENST00000559282	NTSR1	P30989	418 aa		5	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	ATIC	P31939	592 aa		5	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	CYP4F2	P78329	520 aa		5	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	ST3GAL2	Q16842	350 aa		5	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		5	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		5	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		5	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		5	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		5	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		5	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		5	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		5	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		5	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	RNF152	Q8N8N0	203 aa		5	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		5	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		5	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	CIPC	Q9C0C6	399 aa		5	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	CERS4	Q9HA82	394 aa		5	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		5	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	ZNF213	O14771	459 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	TMPRSS11D	O60235	418 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	FGA	P02671	866 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	TM4SF4	P48230	202 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	COPA	P53621	1224 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	PMS2P11	Q13670	270 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	MAP9	Q49MG5	647 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	FAXC	Q5TGI0	409 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	SRL	Q86TD4	932 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	OR2C3	Q8N628	320 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	TERB1	Q8NA31	727 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	HASPIN	Q8TF76	798 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	FAM227B	Q96M60	508 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	AGPS	O00116	658 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	MASP2	O00187	686 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	NCK2	O43639	380 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	GCAT	O75600	419 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	FPR3	P25089	353 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	NHLH1	Q02575	133 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	GPS1	Q13098	491 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	GRM1	Q13255	1194 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	P3H2	Q8IVL5	708 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	ZNF566	Q969W8	418 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	SNX27	Q96L92	541 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282		A8MVJ9	347 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282		H7C1Q1	480 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	OVOL3	O00110	214 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	FGF18	O76093	207 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	PRKCG	P05129	697 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	TMEM225B	P0DP42	221 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	BTK	Q06187	659 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	CLCA4	Q14CN2	919 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	USP49	Q70CQ1	688 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	KRT73	Q86Y46	540 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	REPS1	Q96D71	796 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	SNX18	Q96RF0	628 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	MMS19	Q96T76	1030 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BLM-204	ENST00000559282	LINC01548	A6NM66	108 aa		4.96	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms