RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558534.5

RABGGTA-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 753 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-205ENST00000558534 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 NAGPAQ9UK23 515 aa16.62■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 DNAJC12Q9UKB3 198 aa16.62■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 KMT2EQ8IZD2 1858 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 SYCE3A1L190 88 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 LRRC10BA6NIK2 292 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 THAP12O43422 761 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 ZBED1O96006 694 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 POTEHQ6S545 545 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 TPRG1Q6ZUI0 275 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 STK32AQ8WU08 396 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 IRGQQ8WZA9 623 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 KAT5Q92993 513 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 DNMT3LQ9UJW3 386 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 STRIP2Q9ULQ0 834 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 SIT1Q9Y3P8 196 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 CPQQ9Y646 472 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 PIAS3Q9Y6X2 628 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa16.61■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 COL4A2P08572 1712 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 E2F8A0AVK6 867 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 KRBA1A5PL33 1030 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 LGALS16A8MUM7 142 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 LEFTY2O00292 366 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 CYP26A1O43174 497 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 UCHL3P15374 230 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF18P17022 549 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 BRD2P25440 801 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 AVPR2P30518 371 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 KRT9P35527 623 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 RUNX3Q13761 415 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 RAPGEF1Q13905 1077 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 LRRC32Q14392 662 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 PKDCCQ504Y2 493 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 PM20D1Q6GTS8 502 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 NEK11Q8NG66 645 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 CCDC26Q8TAB7 109 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF606Q8WXB4 792 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 CYP2S1Q96SQ9 504 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 STK33Q9BYT3 514 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 HEBP1Q9NRV9 189 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 GKN1Q9NS71 199 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 CCL26Q9Y258 94 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF510Q9Y2H8 683 aa16.6■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 ARNTLO00327 626 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 COCHO43405 550 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 CCDC172P0C7W6 258 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 RARGP13631 454 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 COG7P83436 770 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 UBXN1Q04323 297 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 ADIGQ0VDE8 80 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 UBXN2BQ14CS0 331 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 C10orf120Q5SQS8 335 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 BTBD8Q5XKL5 378 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 MSANTD4Q8NCY6 345 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 PJA1Q8NG27 643 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 UBA3Q8TBC4 463 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 RNF139Q8WU17 664 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC35F5Q8WV83 523 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM3CQ92520 227 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 RSPRY1Q96DX4 576 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 SPAG5Q96R06 1193 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM83CQ9BQN1 747 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 DCLK3Q9C098 648 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 MIS12Q9H081 205 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 PDCL3Q9H2J4 239 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 LTB4R2Q9NPC1 389 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 SIX2Q9NPC8 291 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 ABCC13Q9NSE7 274 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP16.59■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 PCDHGC3Q9UN70 934 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF318Q5VUA4 2279 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGGTA-205ENST00000558534 A0A1W2PQH9 124 aa16.58■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP16.58■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 KCNMA1Q12791 1236 aa16.58■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 NCAPHQ15003 741 aa16.58■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF677Q86XU0 584 aa16.58■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM71AQ8IYT1 594 aa16.58■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 TTC16Q8NEE8 873 aa16.58■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 TFAP2BQ92481 460 aa16.58■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 ERGIC2Q96RQ1 377 aa16.58■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC22A12Q96S37 553 aa16.58■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 CCSER2Q9H7U1 834 aa16.58■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa16.57■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 ADH1CP00326 375 aa16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms