RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557428.1

PCNX1-215, Transcript of pecanex 1, humanhuman

TSL 4

Gene PCNX1, Length 541 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1-215ENST00000557428 ST3GAL1Q11201 340 aa8.59□□□□□ -1.03
PCNX1-215ENST00000557428 CFAP221Q4G0U5 840 aa8.59□□□□□ -1.03
PCNX1-215ENST00000557428 ARSHQ5FYA8 562 aa8.59□□□□□ -1.03
PCNX1-215ENST00000557428 MDH1BQ5I0G3 518 aa8.59□□□□□ -1.03
PCNX1-215ENST00000557428 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
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PCNX1-215ENST00000557428 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa8.59□□□□□ -1.03
PCNX1-215ENST00000557428 HS2ST1Q7LGA3 356 aa8.59□□□□□ -1.03
PCNX1-215ENST00000557428 GLRX5Q86SX6 157 aa8.59□□□□□ -1.03
PCNX1-215ENST00000557428 SCUBE3Q8IX30 993 aa8.59□□□□□ -1.03
PCNX1-215ENST00000557428 C1orf127Q8N9H9 656 aa8.59□□□□□ -1.03
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PCNX1-215ENST00000557428 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PCNX1-215ENST00000557428 SLITRK1Q96PX8 696 aa8.59□□□□□ -1.03
PCNX1-215ENST00000557428 ACOX2Q99424 681 aa8.59□□□□□ -1.03
PCNX1-215ENST00000557428 PKMYT1Q99640 499 aa8.59□□□□□ -1.03
PCNX1-215ENST00000557428 GPR174Q9BXC1 333 aa8.59□□□□□ -1.03
PCNX1-215ENST00000557428 NACA2Q9H009 215 aa8.59□□□□□ -1.03
PCNX1-215ENST00000557428 EHD2Q9NZN4 543 aa8.59□□□□□ -1.03
PCNX1-215ENST00000557428 TBC1D14Q9P2M4 693 aa8.59□□□□□ -1.03
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PCNX1-215ENST00000557428 GOLGA8IPA6NC78 632 aa8.58□□□□□ -1.04
PCNX1-215ENST00000557428 GOLGA8JA6NMD2 632 aa8.58□□□□□ -1.04
PCNX1-215ENST00000557428 CYSRT1A8MQ03 144 aa8.58□□□□□ -1.04
PCNX1-215ENST00000557428 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa8.58□□□□□ -1.04
PCNX1-215ENST00000557428 PLK4O00444 970 aa8.58□□□□□ -1.04
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PCNX1-215ENST00000557428 CAPN9O14815 690 aa8.58□□□□□ -1.04
PCNX1-215ENST00000557428 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PCNX1-215ENST00000557428 FLRT2O43155 660 aa8.58□□□□□ -1.04
PCNX1-215ENST00000557428 TMEM191BP0C7N4 346 aa8.58□□□□□ -1.04
PCNX1-215ENST00000557428 HLA-EP13747 358 aa8.58□□□□□ -1.04
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PCNX1-215ENST00000557428 PRPHP41219 470 aa8.58□□□□□ -1.04
PCNX1-215ENST00000557428 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
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PCNX1-215ENST00000557428 TAF10Q12962 218 aa8.58□□□□□ -1.04
PCNX1-215ENST00000557428 MCM6Q14566 821 aa8.58□□□□□ -1.04
PCNX1-215ENST00000557428 HLA-BQ31612 363 aa8.58□□□□□ -1.04
PCNX1-215ENST00000557428 DCAF12L1Q5VU92 463 aa8.58□□□□□ -1.04
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PCNX1-215ENST00000557428 MCTP1Q6DN14 999 aa8.58□□□□□ -1.04
PCNX1-215ENST00000557428 DHRS13Q6UX07 377 aa8.58□□□□□ -1.04
PCNX1-215ENST00000557428 BBS7Q8IWZ6 715 aa8.58□□□□□ -1.04
PCNX1-215ENST00000557428 PHTF2Q8N3S3 785 aa8.58□□□□□ -1.04
PCNX1-215ENST00000557428 TOP6BLQ8N6T0 577 aa8.58□□□□□ -1.04
PCNX1-215ENST00000557428 TMC2Q8TDI7 906 aa8.58□□□□□ -1.04
PCNX1-215ENST00000557428 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
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PCNX1-215ENST00000557428 SPATA17Q96L03 361 aa8.58□□□□□ -1.04
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PCNX1-215ENST00000557428 KIF2CQ99661 725 aa8.58□□□□□ -1.04
PCNX1-215ENST00000557428 CDC6Q99741 560 aa8.58□□□□□ -1.04
PCNX1-215ENST00000557428 MTMR12Q9C0I1 747 aa8.58□□□□□ -1.04
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PCNX1-215ENST00000557428 CDH9Q9ULB4 789 aa8.58□□□□□ -1.04
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PCNX1-215ENST00000557428 BOLA1Q9Y3E2 137 aa8.58□□□□□ -1.04
PCNX1-215ENST00000557428 RAI2Q9Y5P3 530 aa8.58□□□□□ -1.04
PCNX1-215ENST00000557428 ASXL3Q9C0F0 2248 aa8.58□□□□□ -1.04
PCNX1-215ENST00000557428 MAST4O15021 2626 aa8.58□□□□□ -1.04
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PCNX1-215ENST00000557428 E2F8A0AVK6 867 aa8.57□□□□□ -1.04
PCNX1-215ENST00000557428 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa8.57□□□□□ -1.04
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PCNX1-215ENST00000557428 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
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PCNX1-215ENST00000557428 MYO1EQ12965 1108 aa8.57□□□□□ -1.04
PCNX1-215ENST00000557428 STARD3Q14849 445 aa8.57□□□□□ -1.04
PCNX1-215ENST00000557428 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PCNX1-215ENST00000557428 SOWAHAQ2M3V2 549 aa8.57□□□□□ -1.04
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PCNX1-215ENST00000557428 IL27RAQ6UWB1 636 aa8.57□□□□□ -1.04
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PCNX1-215ENST00000557428 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PCNX1-215ENST00000557428 TPGS1Q6ZTW0 290 aa8.57□□□□□ -1.04
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PCNX1-215ENST00000557428 NT5DC4Q86YG4 428 aa8.57□□□□□ -1.04
PCNX1-215ENST00000557428 BRSK2Q8IWQ3 736 aa8.57□□□□□ -1.04
PCNX1-215ENST00000557428 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa8.57□□□□□ -1.04
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