RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	FOXJ1	Q92949	421 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	SAAL1	Q96ER3	474 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	GBP4	Q96PP9	640 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	MMS19	Q96T76	1030 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	SNX25	Q9H3E2	840 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	CUEDC2	Q9H467	287 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	COMMD8	Q9NX08	183 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	DEC1	Q9P2X7	70 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	SIX4	Q9UIU6	781 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	KLK13	Q9UKR3	277 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	CACNA1G	O43497	2377 aa		7.27	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688		F8VP50	259 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	TAF4	O00268	1085 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	BIN1	O00499	593 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	KLRC4	O43908	158 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	CAPNS1	P04632	268 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	PDGFRB	P09619	1106 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	CD59	P13987	128 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	GABRG2	P18507	467 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	YWHAQ	P27348	245 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	NTSR1	P30989	418 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	WNT7B	P56706	349 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	UBE2H	P62256	183 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	AMPD3	Q01432	767 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	HECTD3	Q5T447	861 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	UNC13D	Q70J99	1090 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	C12orf40	Q86WS4	652 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	WDR49	Q8IV35	697 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	NUP93	Q8N1F7	819 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	FRMD1	Q8N878	549 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	GPT2	Q8TD30	523 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	FAM84A	Q96KN4	292 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	EXOC1	Q9NV70	894 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	ANTXRL	A6NF34	631 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	GFRA2	O00451	464 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	CLIC2	O15247	247 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	COCH	O43405	550 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	HCRT	O43612	131 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	NDUFS2	O75306	463 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	TULP3	O75386	442 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	HOXB2	P14652	356 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	ZNF132	P52740	706 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	SCAP	Q12770	1279 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	DPYD	Q12882	1025 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	STK4	Q13043	487 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	E2F5	Q15329	346 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	CCDC142	Q17RM4	750 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	ANO4	Q32M45	955 aa		7.26	□□□□□ -1.25

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