RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551676.5

PPP1CC-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PPP1CC, Length 1,581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-208ENST00000551676 CDO1Q16878 200 aa26.91■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 VSTM1Q6UX27 236 aa26.91■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 BNIPLQ7Z465 357 aa26.91■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 TEKT4Q8WW24 435 aa26.91■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 FAM149B1Q96BN6 582 aa26.91■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 TBCBQ99426 244 aa26.91■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 HEMGNQ9BXL5 484 aa26.91■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 ADAM33Q9BZ11 813 aa26.91■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 POPDC2Q9HBU9 364 aa26.91■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa26.91■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa26.9■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 LRRD1A4D1F6 860 aa26.9■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 FYNP06241 537 aa26.9■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 USP17L7P0C7H9 530 aa26.9■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 KDELR1P24390 212 aa26.9■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 ARSEP51690 589 aa26.9■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 SMARCB1Q12824 385 aa26.9■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP26.9■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 LLGL1Q15334 1064 aa26.9■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 SMTNL2Q2TAL5 461 aa26.9■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 ODF2Q5BJF6 829 aa26.9■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 TFDP3Q5H9I0 405 aa26.9■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 KCNT1Q5JUK3 1230 aa26.9■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa26.9■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 KCNT2Q6UVM3 1135 aa26.9■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 NPY6RQ99463 290 aa26.9■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 VN1R3Q9BXE9 311 aa26.9■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 PCYOX1Q9UHG3 505 aa26.9■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 AMACRQ9UHK6 382 aa26.9■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 CARNS1A5YM72 827 aa26.89■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 YJEFN3A6XGL0 299 aa26.89■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 E7ENQ6 273 aa26.89■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 TNFRSF8P28908 595 aa26.89■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 GRIK1P39086 918 aa26.89■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 GPR17Q13304 367 aa26.89■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 USP41Q3LFD5 358 aa26.89■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 HFE2Q6ZVN8 426 aa26.89■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 C8orf48Q96LL4 319 aa26.89■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 RUNDC3BQ96NL0 473 aa26.89■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 GDF3Q9NR23 364 aa26.89■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 CHST7Q9NS84 486 aa26.89■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 HOMER3Q9NSC5 361 aa26.89■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
PPP1CC-208ENST00000551676 FNTAP49354 379 aa26.88■■□□□ 1.89
PPP1CC-208ENST00000551676 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
PPP1CC-208ENST00000551676 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
PPP1CC-208ENST00000551676 FAM117BQ6P1L5 589 aa26.88■■□□□ 1.89
PPP1CC-208ENST00000551676 TTC27Q6P3X3 843 aa26.88■■□□□ 1.89
PPP1CC-208ENST00000551676 SLC39A11Q8N1S5 342 aa26.88■■□□□ 1.89
PPP1CC-208ENST00000551676 ZNF558Q96NG5 402 aa26.88■■□□□ 1.89
PPP1CC-208ENST00000551676 ZMYND10O75800 440 aa26.88■■□□□ 1.89
PPP1CC-208ENST00000551676 TJP3O95049 919 aa26.88■■□□□ 1.89
PPP1CC-208ENST00000551676 LTFP02788 710 aa26.88■■□□□ 1.89
PPP1CC-208ENST00000551676 KRT10P13645 584 aa26.88■■□□□ 1.89
PPP1CC-208ENST00000551676 COILP38432 576 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
PPP1CC-208ENST00000551676 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
PPP1CC-208ENST00000551676 DCAF6Q58WW2 860 aa26.88■■□□□ 1.89
PPP1CC-208ENST00000551676 BEND5Q7L4P6 421 aa26.88■■□□□ 1.89
PPP1CC-208ENST00000551676 IFT20Q8IY31 132 aa26.88■■□□□ 1.89
PPP1CC-208ENST00000551676 KCTD6Q8NC69 237 aa26.88■■□□□ 1.89
PPP1CC-208ENST00000551676 MTRRQ9UBK8 725 aa26.88■■□□□ 1.89
PPP1CC-208ENST00000551676 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa26.88■■□□□ 1.89
PPP1CC-208ENST00000551676 BACE2Q9Y5Z0 518 aa26.88■■□□□ 1.89
PPP1CC-208ENST00000551676 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
PPP1CC-208ENST00000551676 FAM187AA6NFU0 413 aa26.87■■□□□ 1.89
PPP1CC-208ENST00000551676 MDM4O15151 490 aa26.87■■□□□ 1.89
PPP1CC-208ENST00000551676 LAG3P18627 525 aa26.87■■□□□ 1.89
PPP1CC-208ENST00000551676 PTGIRP43119 386 aa26.87■■□□□ 1.89
PPP1CC-208ENST00000551676 ADCY2Q08462 1091 aa26.87■■□□□ 1.89
PPP1CC-208ENST00000551676 CCNG2Q16589 344 aa26.87■■□□□ 1.89
PPP1CC-208ENST00000551676 SYPL2Q5VXT5 272 aa26.87■■□□□ 1.89
PPP1CC-208ENST00000551676 SCYL2Q6P3W7 929 aa26.87■■□□□ 1.89
PPP1CC-208ENST00000551676 OTOP2Q7RTS6 562 aa26.87■■□□□ 1.89
PPP1CC-208ENST00000551676 PIK3R5Q8WYR1 880 aa26.87■■□□□ 1.89
PPP1CC-208ENST00000551676 HSPH1Q92598 858 aa26.87■■□□□ 1.89
PPP1CC-208ENST00000551676 DCLK3Q9C098 648 aa26.87■■□□□ 1.89
PPP1CC-208ENST00000551676 RRN3Q9NYV6 651 aa26.87■■□□□ 1.89
PPP1CC-208ENST00000551676 STAP1Q9ULZ2 295 aa26.87■■□□□ 1.89
PPP1CC-208ENST00000551676 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
PPP1CC-208ENST00000551676 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
PPP1CC-208ENST00000551676 PATJQ8NI35 1801 aa26.86■■□□□ 1.89
PPP1CC-208ENST00000551676 TRIM66O15016 1216 aa26.86■■□□□ 1.89
PPP1CC-208ENST00000551676 TTI1O43156 1089 aa26.86■■□□□ 1.89
PPP1CC-208ENST00000551676 FGBP02675 491 aa26.86■■□□□ 1.89
PPP1CC-208ENST00000551676 SULT1E1P49888 294 aa26.86■■□□□ 1.89
PPP1CC-208ENST00000551676 SLC5A3P53794 718 aa26.86■■□□□ 1.89
PPP1CC-208ENST00000551676 DR1Q01658 176 aa26.86■■□□□ 1.89
PPP1CC-208ENST00000551676 GUCY2DQ02846 1103 aa26.86■■□□□ 1.89
PPP1CC-208ENST00000551676 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
PPP1CC-208ENST00000551676 VSIG1Q86XK7 387 aa26.86■■□□□ 1.89
PPP1CC-208ENST00000551676 FAM71BQ8TC56 605 aa26.86■■□□□ 1.89
PPP1CC-208ENST00000551676 SPPL2BQ8TCT7 592 aa26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms