RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550376.5

PRDM4-205, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM4, Length 2,591 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-205ENST00000550376 HHIPL1Q96JK4 782 aa21.88■■□□□ 1.09
PRDM4-205ENST00000550376 KRT82Q9NSB4 513 aa21.88■■□□□ 1.09
PRDM4-205ENST00000550376 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PRDM4-205ENST00000550376 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PRDM4-205ENST00000550376 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa21.87■■□□□ 1.09
PRDM4-205ENST00000550376 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PRDM4-205ENST00000550376 GABRDO14764 452 aa21.87■■□□□ 1.09
PRDM4-205ENST00000550376 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PRDM4-205ENST00000550376 SEC24CP53992 1094 aa21.87■■□□□ 1.09
PRDM4-205ENST00000550376 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
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PRDM4-205ENST00000550376 CLEC20AQ6ZU45 233 aa21.87■■□□□ 1.09
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PRDM4-205ENST00000550376 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PRDM4-205ENST00000550376 RSAD1Q9HA92 442 aa21.87■■□□□ 1.09
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PRDM4-205ENST00000550376 SAYSD1Q9NPB0 183 aa21.87■■□□□ 1.09
PRDM4-205ENST00000550376 SLC38A7Q9NVC3 462 aa21.87■■□□□ 1.09
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PRDM4-205ENST00000550376 TTC4O95801 387 aa21.87■■□□□ 1.09
PRDM4-205ENST00000550376 UPP1Q16831 310 aa21.87■■□□□ 1.09
PRDM4-205ENST00000550376 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa21.87■■□□□ 1.09
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PRDM4-205ENST00000550376 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa21.86■■□□□ 1.09
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PRDM4-205ENST00000550376 APOC2P02655 101 aa21.86■■□□□ 1.09
PRDM4-205ENST00000550376 NPR3P17342 541 aa21.86■■□□□ 1.09
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PRDM4-205ENST00000550376 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
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PRDM4-205ENST00000550376 SPDYCQ5MJ68 293 aa21.86■■□□□ 1.09
PRDM4-205ENST00000550376 SMYD5Q6GMV2 418 aa21.86■■□□□ 1.09
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PRDM4-205ENST00000550376 DPYSL4O14531 572 aa21.85■■□□□ 1.09
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PRDM4-205ENST00000550376 NKX3-2P78367 333 aa21.85■■□□□ 1.09
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PRDM4-205ENST00000550376 DSC3Q14574 896 aa21.84■■□□□ 1.09
PRDM4-205ENST00000550376 ERMARDQ5T6L9 678 aa21.84■■□□□ 1.09
PRDM4-205ENST00000550376 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PRDM4-205ENST00000550376 CCDC13Q8IYE1 715 aa21.84■■□□□ 1.09
PRDM4-205ENST00000550376 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PRDM4-205ENST00000550376 BCAS4Q8TDM0 211 aa21.84■■□□□ 1.09
PRDM4-205ENST00000550376 TLCD1Q96CP7 247 aa21.84■■□□□ 1.09
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