RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543446.1

IPO8-208, Transcript of importin 8, human

TSL 4

Gene IPO8, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IPO8-208	ENST00000543446	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IPO8-208	ENST00000543446	DECR2	Q9NUI1	292 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IPO8-208	ENST00000543446	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
IPO8-208	ENST00000543446	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IPO8-208	ENST00000543446	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
IPO8-208	ENST00000543446	TMPRSS11D	O60235	418 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	FGF2	P09038	288 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	CCND1	P24385	295 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	PLS1	Q14651	629 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	RFX8	Q6ZV50	586 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	INPPL1	O15357	1258 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	CREB1	P16220	341 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	PDC	P20941	246 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	KCNJ4	P48050	445 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	MTHFS	P49914	203 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	GUCY2F	P51841	1108 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	CCNI	Q14094	377 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	NFATC4	Q14934	902 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	SLC35A4	Q96G79	324 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	MED30	Q96HR3	178 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	HIC2	Q96JB3	615 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	USP22	Q9UPT9	525 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	TH	P07101	528 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	PRKAR1B	P31321	381 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	SLC11A2	P49281	568 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	CFHR3	Q02985	330 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	SPART	Q8N0X7	666 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	CLIC1	O00299	241 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	LINC01565	O15544	149 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	PPAT	Q06203	517 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	SLC14A1	Q13336	389 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	MTMR8	Q96EF0	704 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	MED16	Q9Y2X0	877 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	SPTLC2	O15270	562 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	USP12	O75317	370 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	CAMTA2	O94983	1202 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	NDUFB8	O95169	186 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	BCAT1	P54687	386 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	GAS1	P54826	345 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	PLA1A	Q53H76	456 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	USP45	Q70EL2	814 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	ZNF329	Q86UD4	541 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	PRR18	Q8N4B5	295 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	GABRD	O14764	452 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	GRID2	O43424	1007 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	EPN2	O95208	641 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	EPHA3	P29320	983 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	FAM57B	Q71RH2	274 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	TMEM199	Q8N511	208 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	NEUROG1	Q92886	237 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	MIB2	Q96AX9	1013 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	COG5	Q9UP83	839 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IPO8-208	ENST00000543446	ALG1L2	C9J202	215 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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