RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540665.5

TTC28-AS1-221, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 802 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CLIC5Q9NZA1 410 aa17.04■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NFATC1O95644 943 aa17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SLC9A1P19634 815 aa17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PON1P27169 355 aa17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SOX9P48436 509 aa17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PDE4CQ08493 712 aa17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CNGA2Q16280 664 aa17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TCP11X2Q5H9J9 407 aa17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CDKAL1Q5VV42 579 aa17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TXNDC11Q6PKC3 985 aa17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TADA2BQ86TJ2 420 aa17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SCML4Q8N228 414 aa17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ARHGAP18Q8N392 663 aa17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KCTD13Q8WZ19 329 aa17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TFAP2BQ92481 460 aa17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CRACR2AQ9BSW2 395 aa17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CHRDQ9H2X0 955 aa17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ECT2Q9H8V3 914 aa17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NMUR1Q9HB89 426 aa17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TMEM63CQ9P1W3 806 aa17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 WNT6Q9Y6F9 365 aa17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 E2F8A0AVK6 867 aa17.02■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CHRNB1P11230 501 aa17.02■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ARSAP15289 507 aa17.02■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PGFP49763 221 aa17.02■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LRRC32Q14392 662 aa17.02■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ANGPT1Q15389 498 aa17.02■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PM20D1Q6GTS8 502 aa17.02■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 EXOC4Q96A65 974 aa17.02■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OTUB2Q96DC9 234 aa17.02■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FAM122AQ96E09 287 aa17.02■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CHFRQ96EP1 664 aa17.02■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZSWIM1Q9BR11 485 aa17.02■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NACA2Q9H009 215 aa17.02■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OSER1Q9NX31 292 aa17.02■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SMPD4Q9NXE4 827 aa17.02■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CFAP97Q9P2B7 532 aa17.02■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TBC1D14Q9P2M4 693 aa17.02■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 F5P12259 2224 aa17.02■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 A0A1W2PQH9 124 aa17.01■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 M0QYV0 167 aa17.01■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RARGP13631 454 aa17.01■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KRT5P13647 590 aa17.01■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 BRD2P25440 801 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TKTL1P51854 596 aa17.01■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NR1H3Q13133 447 aa17.01■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa17.01■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DGKKQ5KSL6 1271 aa17.01■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MAMSTRQ6ZN01 415 aa17.01■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SCD5Q86SK9 330 aa17.01■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C1orf210Q8IVY1 113 aa17.01■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TTC8Q8TAM2 541 aa17.01■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SLC35F5Q8WV83 523 aa17.01■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SHC3Q92529 594 aa17.01■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LRRC4Q9HBW1 653 aa17.01■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SIX2Q9NPC8 291 aa17.01■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NAGPAQ9UK23 515 aa17.01■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 H0Y858 1186 aa17■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TULP2O00295 520 aa17■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MED7O43513 233 aa17■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZBED1O96006 694 aa17■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RALAP11233 206 aa17■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GJA4P35212 333 aa17■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MYL5Q02045 173 aa17■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GOLGA8FQ08AF8 430 aa17■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa17■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ADIGQ0VDE8 80 aa17■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CCINQ13939 588 aa17■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TMEM196Q5HYL7 178 aa17■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GJB7Q6PEY0 223 aa17■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 BHLHA9Q7RTU4 235 aa17■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SYNPOQ8N3V7 929 aa17■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TTC16Q8NEE8 873 aa17■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 UBA3Q8TBC4 463 aa17■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CNGB3Q9NQW8 809 aa17■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DNMT3LQ9UJW3 386 aa17■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa17■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 BECN2A8MW95 431 aa16.99■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP16.99■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TYRO3Q06418 890 aa16.99■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PON2Q15165 354 aa16.99■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa16.99■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HSFY1Q96LI6 401 aa16.99■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ULBP1Q9BZM6 244 aa16.99■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LINC00597Q9H2U6 94 aa16.99■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LMAN1LQ9HAT1 526 aa16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms