RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540606.5

ATE1-208, Transcript of arginyltransferase 1, human

TSL 2 BASIC

Gene ATE1, Length 5,165 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATE1-208	ENST00000540606	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	COPS5	Q92905	334 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	IL17RA	Q96F46	866 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	RNF112	Q9ULX5	631 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	VPS9D1	Q9Y2B5	631 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	PPAT	Q06203	517 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	C4orf22	Q6V702	233 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	DNAJC7	Q99615	494 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	RAD18	Q9NS91	495 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	INTS13	Q9NVM9	706 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	IRF6	O14896	467 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	PROSC	O94903	275 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	TPH1	P17752	444 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	VGLL4	Q14135	290 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	HES6	Q96HZ4	224 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606		O00370	1275 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	KLHL2	O95198	593 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	POU6F1	Q14863	301 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	GRIK5	Q16478	980 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	FUT11	Q495W5	492 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	CYGB	Q8WWM9	190 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606		F8W810	466 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	KCNK1	O00180	336 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	ITGAL	P20701	1170 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	PRIM2	P49643	509 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	GALNTL6	Q49A17	601 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	PPCS	Q9HAB8	311 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	KLC4	Q9NSK0	619 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	DIP2A	Q14689	1571 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	TISP43	B9A030	160 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	FBXO21	O94952	628 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	ITGB6	P18564	788 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	SKOR1	P84550	965 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	MOB2	Q70IA6	237 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	MAP3K13	O43283	966 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	CYTH3	O43739	400 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	PGK1	P00558	417 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	PTPRA	P18433	802 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	CCR1	P32246	355 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	ADAM2	Q99965	735 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	IDI2	Q9BXS1	227 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	TNS2	Q63HR2	1409 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	ACKR2	O00590	384 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	KPNA6	O60684	536 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	GPC1	P35052	558 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	CAPZA2	P47755	286 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	PTGIS	Q16647	500 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	MARC1	Q5VT66	337 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	SLC5A5	Q92911	643 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	IGFLR1	Q9H665	355 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATE1-208	ENST00000540606	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22

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