RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540486.5

TRAPPC1-202, Transcript of trafficking protein particle complex 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC1, Length 759 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1-202ENST00000540486 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
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TRAPPC1-202ENST00000540486 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
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TRAPPC1-202ENST00000540486 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa9.47□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
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TRAPPC1-202ENST00000540486 FAM149AA5PLN7 773 aa9.46□□□□□ -0.9
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