RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532457.5

PACSIN3-209, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-209ENST00000532457 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 TLR9Q9NR96 1032 aa23■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 USP3Q9Y6I4 520 aa23■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 CCDC66A2RUB6 948 aa22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 CES2O00748 559 aa22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 ZBED1O96006 694 aa22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 IL1R2P27930 398 aa22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 SSR1P43307 286 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 GLUD2P49448 558 aa22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 PGFP49763 221 aa22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 DUSP4Q13115 394 aa22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 EFHC1Q5JVL4 640 aa22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 TMC7Q7Z402 723 aa22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 UBL4BQ8N7F7 174 aa22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 GPR152Q8TDT2 470 aa22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 PNPLA8Q9NP80 782 aa22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 CNGB3Q9NQW8 809 aa22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 DPYSL4O14531 572 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 GRM6O15303 877 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 LILRB3O75022 631 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 URODP06132 367 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 MAGEA11P43364 429 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 ATP11AP98196 1134 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 VSTM1Q6UX27 236 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 ARCQ7LC44 396 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 DEFB106AQ8N104 65 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 RASGEF1CQ8N431 466 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 GDPD5Q8WTR4 605 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 FBXO21O94952 628 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC5A3P53794 718 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 SYPL2Q5VXT5 272 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 RHOT1Q8IXI2 618 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 GPR65Q8IYL9 337 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 C8orf48Q96LL4 319 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 CARD9Q9H257 536 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 LCMT1Q9UIC8 334 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 LPXNO60711 386 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 CTSAP10619 480 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 MIPP30301 263 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 RWDD2BP57060 319 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 CDO1Q16878 200 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 FAM149B1Q96BN6 582 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 TCF25Q9BQ70 676 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 ZBP1Q9H171 429 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 PCSK1NQ9UHG2 260 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 V9GYY5 206 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 EPOPA6NHQ4 379 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 HSF2BPO75031 334 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 TADA3O75528 432 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 SEC24AO95486 1093 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 GJC1P36383 396 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 USP46P62068 366 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 LLGL1Q15334 1064 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 CEP112Q8N8E3 955 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 ACTRT1Q8TDG2 376 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 TSC1Q92574 1164 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC2A13Q96QE2 648 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 PEBP4Q96S96 227 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 PRDM12Q9H4Q4 367 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 ASNSD1Q9NWL6 643 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 MYO9BQ13459 2157 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 PATJQ8NI35 1801 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 PSTPIP1O43586 416 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 ABLIM3O94929 683 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 MATKP42679 507 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 CREMQ03060 361 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 GRIN2CQ14957 1233 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 ACAP1Q15027 740 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 MNS1Q8NEH6 495 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 SPPL2BQ8TCT7 592 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 KLHL11Q9NVR0 708 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 LMCD1Q9NZU5 365 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 NR2E1Q9Y466 385 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 IRAK3Q9Y616 596 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-209ENST00000532457 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
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