RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530747.5

ARHGEF12-210, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF12, Length 1,930 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12-210ENST00000530747 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
ARHGEF12-210ENST00000530747 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
ARHGEF12-210ENST00000530747 CDC20Q12834 499 aa6.09□□□□□ -1.43
ARHGEF12-210ENST00000530747 USP10Q14694 798 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
ARHGEF12-210ENST00000530747 STARD3Q14849 445 aa6.09□□□□□ -1.43
ARHGEF12-210ENST00000530747 RPS6KA2Q15349 733 aa6.09□□□□□ -1.43
ARHGEF12-210ENST00000530747 PFKFB4Q16877 469 aa6.09□□□□□ -1.43
ARHGEF12-210ENST00000530747 KMT5BQ4FZB7 885 aa6.09□□□□□ -1.43
ARHGEF12-210ENST00000530747 KCTD21Q4G0X4 260 aa6.09□□□□□ -1.43
ARHGEF12-210ENST00000530747 TRIM61Q5EBN2 209 aa6.09□□□□□ -1.43
ARHGEF12-210ENST00000530747 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
ARHGEF12-210ENST00000530747 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa6.09□□□□□ -1.43
ARHGEF12-210ENST00000530747 MACC1Q6ZN28 852 aa6.09□□□□□ -1.43
ARHGEF12-210ENST00000530747 BTLAQ7Z6A9 289 aa6.09□□□□□ -1.43
ARHGEF12-210ENST00000530747 ADCK1Q86TW2 530 aa6.09□□□□□ -1.43
ARHGEF12-210ENST00000530747 LRRC6Q86X45 466 aa6.09□□□□□ -1.43
ARHGEF12-210ENST00000530747 HERC6Q8IVU3 1022 aa6.09□□□□□ -1.43
ARHGEF12-210ENST00000530747 EDEM1Q92611 657 aa6.09□□□□□ -1.43
ARHGEF12-210ENST00000530747 TNFRSF25Q93038 417 aa6.09□□□□□ -1.43
ARHGEF12-210ENST00000530747 SPDL1Q96EA4 605 aa6.09□□□□□ -1.43
ARHGEF12-210ENST00000530747 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa6.09□□□□□ -1.43
ARHGEF12-210ENST00000530747 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
ARHGEF12-210ENST00000530747 B3GNT5Q9BYG0 378 aa6.09□□□□□ -1.43
ARHGEF12-210ENST00000530747 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
ARHGEF12-210ENST00000530747 IL21Q9HBE4 155 aa6.09□□□□□ -1.43
ARHGEF12-210ENST00000530747 INTS13Q9NVM9 706 aa6.09□□□□□ -1.43
ARHGEF12-210ENST00000530747 WWOXQ9NZC7 414 aa6.09□□□□□ -1.43
ARHGEF12-210ENST00000530747 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
ARHGEF12-210ENST00000530747 ZNRF3Q9ULT6 936 aa6.09□□□□□ -1.43
ARHGEF12-210ENST00000530747 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
ARHGEF12-210ENST00000530747 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa6.09□□□□□ -1.43
ARHGEF12-210ENST00000530747 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa6.09□□□□□ -1.43
ARHGEF12-210ENST00000530747 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa6.09□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 GSAPA4D1B5 854 aa6.09□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 RNF103O00237 685 aa6.09□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 ADAM20O43506 726 aa6.09□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 CYTIPO60759 359 aa6.09□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 GUCY1B2O75343 617 aa6.09□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 ULK1O75385 1050 aa6.09□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 GCATO75600 419 aa6.09□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 PNPP00491 289 aa6.09□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 BMP6P22004 513 aa6.09□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 TKTP29401 623 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 LIG3P49916 1009 aa6.09□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 GSDMDP57764 484 aa6.09□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 PMP22Q01453 160 aa6.09□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 GPM6BQ13491 265 aa6.09□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 MORF4L2Q15014 288 aa6.09□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 SLC39A14Q15043 492 aa6.09□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 NDUFA5Q16718 116 aa6.09□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 RGS21Q2M5E4 152 aa6.09□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 ACAD10Q6JQN1 1059 aa6.09□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 ZNF852Q6ZMS4 543 aa6.09□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 RUFY4Q6ZNE9 571 aa6.09□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 HDXQ7Z353 690 aa6.09□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 KBTBD6Q86V97 674 aa6.09□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 SLC43A2Q8N370 569 aa6.09□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 TCAIMQ8N3R3 496 aa6.09□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 BANPQ8N9N5 519 aa6.09□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 LIPHQ8WWY8 451 aa6.09□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 ST8SIA4Q92187 359 aa6.09□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 MED30Q96HR3 178 aa6.09□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 ABHD8Q96I13 439 aa6.09□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 MYRFLQ96LU7 910 aa6.09□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 ITPAQ9BY32 194 aa6.09□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa6.09□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 ADAM19Q9H013 955 aa6.09□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 BATF3Q9NR55 127 aa6.09□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 DOLKQ9UPQ8 538 aa6.09□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 INVSQ9Y283 1065 aa6.09□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 SIK3Q9Y2K2 1263 aa6.09□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 PPIL1Q9Y3C6 166 aa6.09□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa6.09□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa6.09□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 A0A1W2PPW3 197 aa6.08□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 A0A1W2PQH9 124 aa6.08□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 A6NHS1 94 aa6.08□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 DBX1A6NMT0 343 aa6.08□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 PCDH17O14917 1159 aa6.08□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 SCAMP1O15126 338 aa6.08□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 KMOO15229 486 aa6.08□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 TSPAN9O75954 239 aa6.08□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 OTCP00480 354 aa6.08□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 AFPP02771 609 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 JMJD7P0C870 316 aa6.08□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 PRPS2P11908 318 aa6.08□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 TSHRP16473 764 aa6.08□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 RHOQP17081 205 aa6.08□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 PLCG1P19174 1290 aa6.08□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 GPTP24298 496 aa6.08□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 PCSK1P29120 753 aa6.08□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 GATMP50440 423 aa6.08□□□□□ -1.44
ARHGEF12-210ENST00000530747 SERPINB8P50452 374 aa6.08□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms