RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519686.6

VNN3-212, Transcript of vanin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VNN3, Length 1,377 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3-212ENST00000519686 DNAI2Q9GZS0 605 aa9.61□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 RNF38Q9H0F5 515 aa9.61□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa9.61□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 VRTNQ9H8Y1 702 aa9.61□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 KRT82Q9NSB4 513 aa9.61□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 CFAP97Q9P2B7 532 aa9.61□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 NME7Q9Y5B8 376 aa9.61□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa9.61□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 GPR179Q6PRD1 2367 aa9.6□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 AP1G2O75843 785 aa9.6□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 AKAP3O75969 853 aa9.6□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 RHOBTB1O94844 696 aa9.6□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 VNN1O95497 513 aa9.6□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 CYP17A1P05093 508 aa9.6□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 KRT13P13646 458 aa9.6□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 DGKEP52429 567 aa9.6□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 SLC5A3P53794 718 aa9.6□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 DLG4P78352 724 aa9.6□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 ZXDBP98169 803 aa9.6□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 HECTD3Q5T447 861 aa9.6□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 IL31Q6EBC2 164 aa9.6□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 TTC30AQ86WT1 665 aa9.6□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa9.6□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 CCDC150Q8NCX0 1101 aa9.6□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 TSTD1Q8NFU3 115 aa9.6□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 PLEKHO2Q8TD55 490 aa9.6□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 TMEM174Q8WUU8 243 aa9.6□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 ELMO3Q96BJ8 720 aa9.6□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 CCDC34Q96HJ3 373 aa9.6□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 KCTD10Q9H3F6 313 aa9.6□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 TMEM30AQ9NV96 361 aa9.6□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 DMAC2Q9NW81 257 aa9.6□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 TBC1D14Q9P2M4 693 aa9.6□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa9.6□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 ATG2BQ96BY7 2078 aa9.59□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 E2F8A0AVK6 867 aa9.59□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 SLC30A4O14863 429 aa9.59□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 IKBKBO14920 756 aa9.59□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 COCHO43405 550 aa9.59□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 EPN2O95208 641 aa9.59□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 OLFM2O95897 454 aa9.59□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 APODP05090 189 aa9.59□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 ADH5P11766 374 aa9.59□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 CCDC130P13994 396 aa9.59□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 NR2F2P24468 414 aa9.59□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 RPL13P26373 211 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 GBP1P32455 592 aa9.59□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 OPRD1P41143 372 aa9.59□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 VAMP7P51809 220 aa9.59□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 NDUFA8P51970 172 aa9.59□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 NDST1P52848 882 aa9.59□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 ORC1Q13415 861 aa9.59□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 DHCR24Q15392 516 aa9.59□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 CCDC6Q16204 474 aa9.59□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 ZACNQ401N2 412 aa9.59□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 BTBD8Q5XKL5 378 aa9.59□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 SV2AQ7L0J3 742 aa9.59□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 SCAMP5Q8TAC9 235 aa9.59□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 SLC2A14Q8TDB8 520 aa9.59□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 PNKPQ96T60 521 aa9.59□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 FBXO44Q9H4M3 255 aa9.59□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 FAM49BQ9NUQ9 324 aa9.59□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 COMMD8Q9NX08 183 aa9.59□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 EBF1Q9UH73 591 aa9.59□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa9.59□□□□□ -0.87
VNN3-212ENST00000519686 MYO16Q9Y6X6 1858 aa9.58□□□□□ -0.88
VNN3-212ENST00000519686 CEP250Q9BV73 2442 aa9.58□□□□□ -0.88
VNN3-212ENST00000519686 CACNA1AO00555 2505 aa9.58□□□□□ -0.88
VNN3-212ENST00000519686 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
VNN3-212ENST00000519686 K7EQS6 105 aa9.58□□□□□ -0.88
VNN3-212ENST00000519686 GDF9O60383 454 aa9.58□□□□□ -0.88
VNN3-212ENST00000519686 ALDH1A2O94788 518 aa9.58□□□□□ -0.88
VNN3-212ENST00000519686 HLA-DRAP01903 254 aa9.58□□□□□ -0.88
VNN3-212ENST00000519686 ZNF806P0C7X5 589 aa9.58□□□□□ -0.88
VNN3-212ENST00000519686 FAM200BP0CF97 657 aa9.58□□□□□ -0.88
VNN3-212ENST00000519686 IRF1P10914 325 aa9.58□□□□□ -0.88
VNN3-212ENST00000519686 ADORA2BP29275 332 aa9.58□□□□□ -0.88
VNN3-212ENST00000519686 MPLP40238 635 aa9.58□□□□□ -0.88
VNN3-212ENST00000519686 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
VNN3-212ENST00000519686 TUBP50607 506 aa9.58□□□□□ -0.88
VNN3-212ENST00000519686 MAP3K7CLP57077 242 aa9.58□□□□□ -0.88
VNN3-212ENST00000519686 KDSRQ06136 332 aa9.58□□□□□ -0.88
VNN3-212ENST00000519686 GOLGA8FQ08AF8 430 aa9.58□□□□□ -0.88
VNN3-212ENST00000519686 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa9.58□□□□□ -0.88
VNN3-212ENST00000519686 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
VNN3-212ENST00000519686 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
VNN3-212ENST00000519686 PPM1JQ5JR12 505 aa9.58□□□□□ -0.88
VNN3-212ENST00000519686 ANO7Q6IWH7 933 aa9.58□□□□□ -0.88
VNN3-212ENST00000519686 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
VNN3-212ENST00000519686 C11orf74Q86VG3 221 aa9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.7 ms