RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518928.1

TSNARE1-203, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene TSNARE1, Length 940 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-203ENST00000518928 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa14.97□□□□□ -0.01
TSNARE1-203ENST00000518928 P2RY11Q96G91 374 aa14.97□□□□□ -0.01
TSNARE1-203ENST00000518928 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
TSNARE1-203ENST00000518928 IER2Q9BTL4 223 aa14.97□□□□□ -0.01
TSNARE1-203ENST00000518928 IMPG2Q9BZV3 1241 aa14.97□□□□□ -0.01
TSNARE1-203ENST00000518928 IL37Q9NZH6 218 aa14.97□□□□□ -0.01
TSNARE1-203ENST00000518928 DACH1Q9UI36 760 aa14.97□□□□□ -0.01
TSNARE1-203ENST00000518928 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
TSNARE1-203ENST00000518928 K7EQS6 105 aa14.96□□□□□ -0.01
TSNARE1-203ENST00000518928 PMM2O15305 246 aa14.96□□□□□ -0.01
TSNARE1-203ENST00000518928 CCDC192P0DO97 292 aa14.96□□□□□ -0.01
TSNARE1-203ENST00000518928 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
TSNARE1-203ENST00000518928 P4HA1P13674 534 aa14.96□□□□□ -0.01
TSNARE1-203ENST00000518928 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP14.96□□□□□ -0.012e-7■■■■■ 35.2
TSNARE1-203ENST00000518928 YWHAQP27348 245 aa14.96□□□□□ -0.01
TSNARE1-203ENST00000518928 SEC13P55735 322 aa14.96□□□□□ -0.01
TSNARE1-203ENST00000518928 SPEM2Q0P670 501 aa14.96□□□□□ -0.01
TSNARE1-203ENST00000518928 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
TSNARE1-203ENST00000518928 CCDC6Q16204 474 aa14.96□□□□□ -0.01
TSNARE1-203ENST00000518928 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa14.96□□□□□ -0.01
TSNARE1-203ENST00000518928 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
TSNARE1-203ENST00000518928 C1orf228Q6PIY5 440 aa14.96□□□□□ -0.01
TSNARE1-203ENST00000518928 SASS6Q6UVJ0 657 aa14.96□□□□□ -0.01
TSNARE1-203ENST00000518928 CLEC20AQ6ZU45 233 aa14.96□□□□□ -0.01
TSNARE1-203ENST00000518928 LONP2Q86WA8 852 aa14.96□□□□□ -0.01
TSNARE1-203ENST00000518928 CREBRFQ8IUR6 639 aa14.96□□□□□ -0.01
TSNARE1-203ENST00000518928 CRYBG2Q8N1P7 616 aa14.96□□□□□ -0.01
TSNARE1-203ENST00000518928 LMO3Q8TAP4 145 aa14.96□□□□□ -0.01
TSNARE1-203ENST00000518928 CD101Q93033 1021 aa14.96□□□□□ -0.01
TSNARE1-203ENST00000518928 ATP2A3Q93084 1043 aa14.96□□□□□ -0.01
TSNARE1-203ENST00000518928 SMARCD1Q96GM5 515 aa14.96□□□□□ -0.01
TSNARE1-203ENST00000518928 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
TSNARE1-203ENST00000518928 NIF3L1Q9GZT8 377 aa14.96□□□□□ -0.01
TSNARE1-203ENST00000518928 NMUR1Q9HB89 426 aa14.96□□□□□ -0.01
TSNARE1-203ENST00000518928 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
TSNARE1-203ENST00000518928 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
TSNARE1-203ENST00000518928 NUDT5Q9UKK9 219 aa14.96□□□□□ -0.01
TSNARE1-203ENST00000518928 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP14.96□□□□□ -0.01
TSNARE1-203ENST00000518928 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
TSNARE1-203ENST00000518928 FAM92AA1XBS5 289 aa14.95□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 DCLK1O15075 740 aa14.95□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 MDM4O15151 490 aa14.95□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 TRIM24O15164 1050 aa14.95□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 CYP26A1O43174 497 aa14.95□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa14.95□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 INCA1Q0VD86 236 aa14.95□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 KLHL40Q2TBA0 621 aa14.95□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 ZNF394Q53GI3 561 aa14.95□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 EMC10Q5UCC4 262 aa14.95□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 RHBDF2Q6PJF5 856 aa14.95□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 WDR5BQ86VZ2 330 aa14.95□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa14.95□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 CEP295NLQ96MC4 621 aa14.95□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 SMOC1Q9H4F8 434 aa14.95□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 THAP9Q9H5L6 903 aa14.95□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa14.95□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 ANO10Q9NW15 660 aa14.95□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 SPTBN2O15020 2390 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 GREM1O60565 184 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 CILPO75339 1184 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 AFPP02771 609 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 IRF1P10914 325 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 TYRO3Q06418 890 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 LRMPQ12912 555 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 DHCR24Q15392 516 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 STX1AQ16623 288 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 KBTBD6Q86V97 674 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 BBS7Q8IWZ6 715 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 SYNPOQ8N3V7 929 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 CCDC150Q8NCX0 1101 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 TNIP3Q96KP6 325 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 SLITRK1Q96PX8 696 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 CYP3A43Q9HB55 503 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 RXFP3Q9NSD7 469 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 USP18Q9UMW8 372 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 INVSQ9Y283 1065 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 NCOR2Q9Y618 2525 aa14.94□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 MYH10P35580 1976 aa14.93□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 P4HA2O15460 535 aa14.93□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 GDF9O60383 454 aa14.93□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 DRD1P21728 446 aa14.93□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 NRLP54845 237 aa14.93□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 KDSRQ06136 332 aa14.93□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 C2orf27AQ580R0 203 aa14.93□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 LY6G5CQ5SRR4 150 aa14.93□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 UNC93AQ86WB7 457 aa14.93□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 PHTF2Q8N3S3 785 aa14.93□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 CCDC33Q8N5R6 958 aa14.93□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 EHBP1Q8NDI1 1231 aa14.93□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 USP33Q8TEY7 942 aa14.93□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 FAXDC2Q96IV6 333 aa14.93□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 DLL3Q9NYJ7 618 aa14.93□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 HCN2Q9UL51 889 aa14.93□□□□□ -0.02
TSNARE1-203ENST00000518928 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms