RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516259.1

RNU6-390P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 390, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-390P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-390P-201ENST00000516259 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 TAF12Q16514 161 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 GEN1Q17RS7 908 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 VPS53Q5VIR6 699 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 NAA35Q5VZE5 725 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 VWA1Q6PCB0 445 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 TTLL10Q6ZVT0 673 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 BBS12Q6ZW61 710 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 PCGF5Q86SE9 256 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZNF276Q8N554 614 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 SIMC1Q8NDZ2 872 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 ATRIPQ8WXE1 791 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 ATG4AQ8WYN0 398 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 TMEM125Q96AQ2 219 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 NPAS1Q99742 590 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 C17orf80Q9BSJ5 609 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 TEX101Q9BY14 249 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 TBCCD1Q9NVR7 557 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 RRN3Q9NYV6 651 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 RIMKLBQ9ULI2 386 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 SNX14Q9Y5W7 946 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 PIPSLA2A3N6 862 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 H0Y3Z8 333 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 J3KTA2 159 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 K7ESM1 405 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 MPPED1O15442 326 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 DNPH1O43598 174 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 TAF5LO75529 589 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 WDR47O94967 919 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 NXPH3O95157 252 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 CNPP09543 421 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 HOXA5P20719 270 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 MMP8P22894 467 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 PTGS2P35354 604 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 CASP2P42575 452 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP3.79□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 MTHFSP49914 203 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 GUCY1B3Q02153 619 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 MTAPQ13126 283 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 NFIXQ14938 502 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 FAM90A2PQ658T7 463 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 RINT1Q6NUQ1 792 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 USP51Q70EK9 711 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 RASGRP2Q7LDG7 609 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 TSPYL6Q8N831 410 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 CHST13Q8NET6 341 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 OR1N1Q8NGS0 311 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 SCAMP5Q8TAC9 235 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 IL17DQ8TAD2 202 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 CPT1BQ92523 772 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 RNF31Q96EP0 1072 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 ACTRT3Q9BYD9 372 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 VPS16Q9H269 839 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 MLXIPQ9HAP2 919 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 GLOD4Q9HC38 313 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 KLC4Q9NSK0 619 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 SERTAD3Q9UJW9 196 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 FEM1BQ9UK73 627 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 DAPP1Q9UN19 280 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 CNTN6Q9UQ52 1028 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 ITIH6Q6UXX5 1313 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 RRN3P2A6NIE6 340 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 B9A039 149 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 J3KRW8 73 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 AGPSO00116 658 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 PSMD9O00233 223 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 PLSCR1O15162 318 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 CTIFO43310 598 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 SPDEFO95238 335 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 NDUFA10O95299 355 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 DLDP09622 509 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 HGFP14210 728 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 TGM1P22735 817 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 NR4A1P22736 598 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 SLC25A3Q00325 362 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 BMPR2Q13873 1038 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 GRM4Q14833 912 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 TAF5Q15542 800 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 ANKRD45Q5TZF3 282 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 RETSATQ6NUM9 610 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-390P-201ENST00000516259 MSANTD2Q6P1R3 559 aa3.78□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms