RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503080.1

UBE2B-203, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2B, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-203ENST00000503080 COPB1P53618 953 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 KRTAP10-11P60412 298 aa5□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 RHDQ02161 417 aa5□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 EPHA10Q5JZY3 1008 aa5□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 C11orf87Q6NUJ2 197 aa5□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 PRSS22Q9GZN4 317 aa5□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 PRDM11Q9NQV5 511 aa5□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 SNX15Q9NRS6 342 aa5□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 KLHL13Q9P2N7 655 aa5□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 MGAT4CQ9UBM8 478 aa5□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 DKK4Q9UBT3 224 aa5□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa5□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa4.99□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 AQP7P3A6NL99 342 aa4.99□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 BTBD19C9JJ37 291 aa4.99□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 AGPSO00116 658 aa4.99□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 ATF3P18847 181 aa4.99□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 SEMA5AQ13591 1074 aa4.99□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 GALEQ14376 348 aa4.99□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 DENND2CQ68D51 928 aa4.99□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 C11orf44Q8N8P7 122 aa4.99□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 DENND1AQ8TEH3 1009 aa4.99□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 WDYHV1Q96HA8 205 aa4.99□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 MSLNLQ96KJ4 702 aa4.99□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 EFHD1Q9BUP0 239 aa4.99□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 FAM83DQ9H4H8 585 aa4.99□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 TMEM232C9JQI7 657 aa4.98□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 TMPRSS11DO60235 418 aa4.98□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 INMTO95050 263 aa4.98□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 APEHP13798 732 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 PHKG2P15735 406 aa4.98□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 IL1R2P27930 398 aa4.98□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 NTSR1P30989 418 aa4.98□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 CARSP49589 748 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 KCNAB1Q14722 419 aa4.98□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 AWAT1Q58HT5 328 aa4.98□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 PLAG1Q6DJT9 500 aa4.98□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 CYB5RLQ6IPT4 315 aa4.98□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 ZNF813Q6ZN06 617 aa4.98□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 METTL25Q8N6Q8 603 aa4.98□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 SNX22Q96L94 193 aa4.98□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 TRIM36Q9NQ86 728 aa4.98□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 F8W8V4 182 aa4.97□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 BCAR3O75815 825 aa4.97□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 MT-ND5P03915 603 aa4.97□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 CD19P15391 556 aa4.97□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 RPL17P18621 184 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 MMP13P45452 471 aa4.97□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 C4orf46Q504U0 113 aa4.97□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 TMEM65Q6PI78 240 aa4.97□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 USP49Q70CQ1 688 aa4.97□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 HS6ST2Q96MM7 605 aa4.97□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa4.97□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 FAM118BQ9BPY3 351 aa4.97□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 APOL5Q9BWW9 433 aa4.97□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 NUP62CLQ9H1M0 184 aa4.97□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 TBC1D23Q9NUY8 699 aa4.97□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 KLHL42Q9P2K6 505 aa4.97□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 ZNF212Q9UDV6 495 aa4.97□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 RIMKLBQ9ULI2 386 aa4.97□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 SNX13Q9Y5W8 968 aa4.97□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 ZNF521Q96K83 1311 aa4.97□□□□□ -1.61
UBE2B-203ENST00000503080 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
UBE2B-203ENST00000503080 SNX2O60749 519 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE2B-203ENST00000503080 MOSPD3O75425 235 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE2B-203ENST00000503080 A1BGP04217 495 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE2B-203ENST00000503080 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
UBE2B-203ENST00000503080 MCM5P33992 734 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE2B-203ENST00000503080 PTGER1P34995 402 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE2B-203ENST00000503080 DEUP1Q05D60 604 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE2B-203ENST00000503080 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
UBE2B-203ENST00000503080 MANEALQ5VSG8 457 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE2B-203ENST00000503080 MZT2AQ6P582 158 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE2B-203ENST00000503080 CLEC9AQ6UXN8 241 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE2B-203ENST00000503080 DCDC5Q6ZRR9 648 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE2B-203ENST00000503080 FMNL3Q8IVF7 1028 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE2B-203ENST00000503080 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE2B-203ENST00000503080 LINC01465Q8N7H1 131 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE2B-203ENST00000503080 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
UBE2B-203ENST00000503080 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE2B-203ENST00000503080 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
UBE2B-203ENST00000503080 TIFAQ96CG3 184 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE2B-203ENST00000503080 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
UBE2B-203ENST00000503080 BTBD1Q9H0C5 482 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE2B-203ENST00000503080 VPS16Q9H269 839 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE2B-203ENST00000503080 DNAJB11Q9UBS4 358 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE2B-203ENST00000503080 STEAP1Q9UHE8 339 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE2B-203ENST00000503080 ASAP1Q9ULH1 1129 aa4.96□□□□□ -1.62
UBE2B-203ENST00000503080 CAPN11Q9UMQ6 739 aa4.96□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms