RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498713.1

ANKRD28-214, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 1,091 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-214ENST00000498713 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa7.06□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 PARP2Q9UGN5 583 aa7.06□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 DERAQ9Y315 318 aa7.06□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 C2CD2Q9Y426 696 aa7.06□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa7.06□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 NUB1Q9Y5A7 615 aa7.06□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 TANC1Q9C0D5 1861 aa7.06□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 MICAL3Q7RTP6 2002 aa7.06□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 ANO9A1A5B4 782 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 PRR33A8MZF0 331 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 C9IYK1 514 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 F8VZ95 297 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 H3BS24 57 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 PTGESO14684 152 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 ARHGAP6O43182 974 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 SERPING1P05155 500 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 TMEM191BP0C7N4 346 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 ITGA4P13612 1032 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 PI3P19957 117 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 SOX5P35711 763 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 STAT1P42224 750 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 PIK3CAP42336 1068 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 KCNJ6P48051 423 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 YARSP54577 528 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 MFAP3P55082 362 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 BIRC3Q13489 604 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 RAPGEF1Q13905 1077 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 TMEM132DQ14C87 1099 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 ARHGAP44Q17R89 818 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 THAP5Q7Z6K1 395 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 ECHDC2Q86YB7 292 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 REXO1L1PQ8IX06 675 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 FAM71AQ8IYT1 594 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 DBF4BQ8NFT6 615 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 OLIG1Q8TAK6 271 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 LINC01599Q8WXQ3 324 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 SHC3Q92529 594 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 LPPQ93052 612 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 JAKMIP2Q96AA8 810 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 NT5C1BQ96P26 610 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 SORCS2Q96PQ0 1159 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 SYT11Q9BT88 431 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 BDH2Q9BUT1 245 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 APOL6Q9BWW8 343 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 WNT8AQ9H1J5 351 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 HAUS4Q9H6D7 363 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 AGAP1Q9UPQ3 857 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 CNTN6Q9UQ52 1028 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 ST14Q9Y5Y6 855 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 A0A0U1RQJ8 604 aa7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 ARL5CA6NH57 179 aa7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 USP27XA6NNY8 438 aa7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 PIRO00625 290 aa7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 PPEF2O14830 753 aa7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 ZNF263O14978 683 aa7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 OFD1O75665 1012 aa7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 GFPT2O94808 682 aa7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 NDUFA10O95299 355 aa7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 LCA5LO95447 670 aa7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 CXCL10P02778 98 aa7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 ITGB3P05106 788 aa7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 FERP16591 822 aa7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 EN2P19622 333 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 ACO1P21399 889 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 RFX1P22670 979 aa7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 ITGB8P26012 769 aa7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 CYP2C18P33260 490 aa7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 PRKCIP41743 596 aa7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 HK2P52789 917 aa7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 CCL23P55773 120 aa7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 RBP5P82980 135 aa7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 GCNT1Q02742 428 aa7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 ARID5AQ03989 594 aa7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 KLHL30Q0D2K2 578 aa7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 TRPC3Q13507 836 aa7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 CUL2Q13617 745 aa7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 NAB2Q15742 525 aa7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 ASIC2Q16515 512 aa7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 GLRA4Q5JXX5 417 aa7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 C9orf57Q5W0N0 161 aa7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 SLC24A5Q71RS6 500 aa7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 NECAB2Q7Z6G3 386 aa7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-214ENST00000498713 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms