RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492741.5

PSPC1-204, Transcript of paraspeckle component 1, humanhuman

TSL 2

Gene PSPC1, Length 1,709 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1-204ENST00000492741 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
PSPC1-204ENST00000492741 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP23.1■■□□□ 1.297e-7■■■□□ 16.1
PSPC1-204ENST00000492741 FBXO32Q969P5 355 aa23.1■■□□□ 1.29
PSPC1-204ENST00000492741 POPDC2Q9HBU9 364 aa23.1■■□□□ 1.29
PSPC1-204ENST00000492741 ASNSD1Q9NWL6 643 aa23.1■■□□□ 1.29
PSPC1-204ENST00000492741 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP23.1■■□□□ 1.29
PSPC1-204ENST00000492741 EHD2Q9NZN4 543 aa23.1■■□□□ 1.29
PSPC1-204ENST00000492741 AMFRQ9UKV5 643 aa23.1■■□□□ 1.29
PSPC1-204ENST00000492741 USTQ9Y2C2 406 aa23.1■■□□□ 1.29
PSPC1-204ENST00000492741 EPOPA6NHQ4 379 aa23.09■■□□□ 1.29
PSPC1-204ENST00000492741 RFXAPO00287 272 aa23.09■■□□□ 1.29
PSPC1-204ENST00000492741 PER2O15055 1255 aa23.09■■□□□ 1.29
PSPC1-204ENST00000492741 SPOPO43791 374 aa23.09■■□□□ 1.29
PSPC1-204ENST00000492741 CSH1P0DML2 217 aa23.09■■□□□ 1.29
PSPC1-204ENST00000492741 CSH2P0DML3 217 aa23.09■■□□□ 1.29
PSPC1-204ENST00000492741 SSR1P43307 286 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
PSPC1-204ENST00000492741 PLD1Q13393 1074 aa23.09■■□□□ 1.29
PSPC1-204ENST00000492741 HFE2Q6ZVN8 426 aa23.09■■□□□ 1.29
PSPC1-204ENST00000492741 COMMD8Q9NX08 183 aa23.09■■□□□ 1.29
PSPC1-204ENST00000492741 FBXW11Q9UKB1 542 aa23.09■■□□□ 1.29
PSPC1-204ENST00000492741 SCML2Q9UQR0 700 aa23.09■■□□□ 1.29
PSPC1-204ENST00000492741 JRKLQ9Y4A0 524 aa23.09■■□□□ 1.29
PSPC1-204ENST00000492741 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa23.09■■□□□ 1.29
PSPC1-204ENST00000492741 CTAGE9A4FU28 777 aa23.08■■□□□ 1.29
PSPC1-204ENST00000492741 C2CD4BA6NLJ0 364 aa23.08■■□□□ 1.29
PSPC1-204ENST00000492741 ENC1O14682 589 aa23.08■■□□□ 1.29
PSPC1-204ENST00000492741 PROSCO94903 275 aa23.08■■□□□ 1.29
PSPC1-204ENST00000492741 LRG1P02750 347 aa23.08■■□□□ 1.29
PSPC1-204ENST00000492741 COMTP21964 271 aa23.08■■□□□ 1.29
PSPC1-204ENST00000492741 SDC4P31431 198 aa23.08■■□□□ 1.29
PSPC1-204ENST00000492741 OGDHQ02218 1023 aa23.08■■□□□ 1.29
PSPC1-204ENST00000492741 DCAF6Q58WW2 860 aa23.08■■□□□ 1.29
PSPC1-204ENST00000492741 SLFN11Q7Z7L1 901 aa23.08■■□□□ 1.29
PSPC1-204ENST00000492741 DEFB106AQ8N104 65 aa23.08■■□□□ 1.29
PSPC1-204ENST00000492741 FNIP1Q8TF40 1166 aa23.08■■□□□ 1.29
PSPC1-204ENST00000492741 CFAP57Q96MR6 1250 aa23.08■■□□□ 1.29
PSPC1-204ENST00000492741 TLE6Q9H808 572 aa23.08■■□□□ 1.29
PSPC1-204ENST00000492741 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 C8AP07357 584 aa23.08■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 NCAM1P13591 858 aa23.08■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 SLC1A1P43005 524 aa23.08■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP23.08■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 BSPRYQ5W0U4 402 aa23.08■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 BTBD8Q5XKL5 378 aa23.08■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 ARCQ7LC44 396 aa23.08■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 MON1AQ86VX9 555 aa23.08■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 SLITRK1Q96PX8 696 aa23.08■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 TRIM62Q9BVG3 475 aa23.08■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 CHD7Q9P2D1 2997 aa23.07■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 SPDYE4A6NLX3 237 aa23.07■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 DAB1O75553 588 aa23.07■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 RNF8O76064 485 aa23.07■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 MATKP42679 507 aa23.07■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 ATP11AP98196 1134 aa23.07■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 TAF10Q12962 218 aa23.07■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 CDO1Q16878 200 aa23.07■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 ARHGAP18Q8N392 663 aa23.07■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 KIF18AQ8NI77 898 aa23.07■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 EDEM1Q92611 657 aa23.07■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 CNPY3Q9BT09 278 aa23.07■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF576Q9H609 170 aa23.07■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 IL37Q9NZH6 218 aa23.07■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 CHD9Q3L8U1 2897 aa23.07■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 A0A1W2PPC1 479 aa23.06■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 NOS2P35228 1153 aa23.06■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 DNA2P51530 1060 aa23.06■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa23.06■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 PPM1LQ5SGD2 360 aa23.06■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 TRNP1Q6NT89 227 aa23.06■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 BHLHA9Q7RTU4 235 aa23.06■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa23.06■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 ITIH5Q86UX2 942 aa23.06■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 NT5DC3Q86UY8 548 aa23.06■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 ELMOD1Q8N336 334 aa23.06■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa23.06■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 MAN1C1Q9NR34 630 aa23.06■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 ABCC13Q9NSE7 274 aa23.06■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 GMIPQ9P107 970 aa23.06■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 STAP1Q9ULZ2 295 aa23.06■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa23.06■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 LAMA3Q16787 3333 aa23.06■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 PATJQ8NI35 1801 aa23.06■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 A0A1W2PQH9 124 aa23.05■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 NCK2O43639 380 aa23.05■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 LRIT3Q3SXY7 679 aa23.05■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 CCDC14Q49A88 953 aa23.05■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 MEI1Q5TIA1 1274 aa23.05■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 SLC2A13Q96QE2 648 aa23.05■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 DPP7Q9UHL4 492 aa23.05■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 EPCAMP16422 314 aa23.05■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 MAN1A1P33908 653 aa23.05■■□□□ 1.28
PSPC1-204ENST00000492741 NRIP1P48552 1158 aa23.05■■□□□ 1.28
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