RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	BICDL2	A1A5D9	508 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	SMTNL1	A8MU46	457 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	LGALS16	A8MUM7	142 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	BECN2	A8MW95	431 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	KBTBD13	C9JR72	458 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	TOM1L1	O75674	476 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	NOL4	O94818	638 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	GHR	P10912	638 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	GNAT1	P11488	350 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMOD1	P28289	359 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	CD52	P31358	61 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	THPO	P40225	353 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	ACOT2	P49753	483 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	EFNA5	P52803	228 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	MYBPC2	Q14324	1141 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	CBWD6	Q4V339	395 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	USP53	Q70EK8	1073 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	NME8	Q8N427	588 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	SEMA4D	Q92854	862 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	NINJ1	Q92982	152 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAP7D2	Q96T17	732 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM206	Q9H813	350 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	SIX2	Q9NPC8	291 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	GPR27	Q9NS67	375 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	TBX21	Q9UL17	535 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	HES2	Q9Y543	173 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	NOTO	A8MTQ0	251 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	CETN3	O15182	167 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	EXTL3	O43909	919 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	B4GALT3	O60512	393 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	EXOC3	O60645	756 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	EFCAB14	O75071	495 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	VNN1	O95497	513 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	NPTXR	O95502	500 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	ACTN1	P12814	892 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	CYP2C18	P33260	490 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	LTBR	P36941	435 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPP1R2	P41236	205 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	LIG4	P49917	911 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	GUCY2F	P51841	1108 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	OSTN	P61366	133 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	CYP24A1	Q07973	514 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	STIM1	Q13586	685 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	TFDP1	Q14186	410 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	NR0B2	Q15466	257 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAPK6	Q16659	721 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARTN	Q5T4W7	220 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	VSTM4	Q8IW00	320 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	NAT16	Q8N8M0	369 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	DIO2	Q92813	273 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCDC120	Q96HB5	630 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	SCLY	Q96I15	445 aa		6.64	□□□□□ -1.35

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