RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 MTMR9Q96QG7 549 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 RPS6KC1Q96S38 1066 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 CSRNP2Q9H175 543 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 SFXN1Q9H9B4 322 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 ANKEF1Q9NU02 776 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 GIT1Q9Y2X7 761 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 IPPQ9Y573 584 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 KCTD3Q9Y597 815 aa7.05□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 MYO10Q9HD67 2058 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 A0A1B0GUA9 196 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 F8W810 466 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 N4BP3O15049 544 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 PI15O43692 258 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 BAG4O95429 457 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 CYBBP04839 570 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 DBHP09172 617 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 XBP1P17861 261 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 PI3P19957 117 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 GLRA2P23416 452 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 MAPKAPK2P49137 400 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 RARRES1P49788 294 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 CDR1P51861 262 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 ANAPC15P60006 121 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 CYP4A11Q02928 519 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 MBTD1Q05BQ5 628 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 TDGQ13569 410 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 CAPSQ13938 189 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 SSPNQ14714 243 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 FXNQ16595 210 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 XKR9Q5GH70 373 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 NCAPH2Q6IBW4 605 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 NOTUMQ6P988 496 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 PAQR3Q6TCH7 311 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 CCDC149Q6ZUS6 474 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 CPNE8Q86YQ8 564 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 TPH2Q8IWU9 490 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 HDAC7Q8WUI4 952 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 CPB2Q96IY4 423 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 GAD1Q99259 594 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 FZD8Q9H461 694 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 FNIP2Q9P278 1114 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 IGSF9Q9P2J2 1179 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 EPS15L1Q9UBC2 864 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 PCDHA12Q9UN75 941 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 DUSP12Q9UNI6 340 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 HES2Q9Y543 173 aa7.04□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 BTBD18B2RXH4 712 aa7.03□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 B4GALT5O43286 388 aa7.03□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 ERLIN2O94905 339 aa7.03□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 LARGE1O95461 756 aa7.03□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 AOC1P19801 751 aa7.03□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 CA8P35219 290 aa7.03□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 KRT2P35908 639 aa7.03□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 MLH1P40692 756 aa7.03□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 OR1G1P47890 313 aa7.03□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 SCNN1GP51170 649 aa7.03□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 AK2P54819 239 aa7.03□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 ME3Q16798 604 aa7.03□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM187BQ17R55 369 aa7.03□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 SV2CQ496J9 727 aa7.03□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 ASCL5Q7RTU5 278 aa7.03□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 TRIM59Q8IWR1 403 aa7.03□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC44A3Q8N4M1 653 aa7.03□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 LZTR1Q8N653 840 aa7.03□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 WASF1Q92558 559 aa7.03□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 MYADMQ96S97 322 aa7.03□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 LGR4Q9BXB1 951 aa7.03□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 NT5C3AQ9H0P0 336 aa7.03□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa7.03□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 MAN1C1Q9NR34 630 aa7.03□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 WNT16Q9UBV4 365 aa7.03□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 DPP7Q9UHL4 492 aa7.03□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa7.03□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 DNAH14Q0VDD8 3507 aa7.03□□□□□ -1.28
PRPF40A-210ENST00000489741 A0A087WWV3 80 aa7.02□□□□□ -1.29
PRPF40A-210ENST00000489741 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.02□□□□□ -1.29
PRPF40A-210ENST00000489741 PRR23AA6NEV1 266 aa7.02□□□□□ -1.29
PRPF40A-210ENST00000489741 ANHXE9PGG2 379 aa7.02□□□□□ -1.29
PRPF40A-210ENST00000489741 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa7.02□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms