RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486016.1

GCFC2-209, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, human

TSL 3

Gene GCFC2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCFC2-209	ENST00000486016	CHPF	Q8IZ52	775 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	CDH19	Q9H159	772 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	TTC3	P53804	2025 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	CCP110	O43303	1012 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	SRGAP2	O75044	1071 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	CREB1	P16220	341 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	PRKAR1B	P31321	381 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	MCM5	P33992	734 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	TMEM65	Q6PI78	240 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	RANBP10	Q6VN20	620 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	CUL5	Q93034	780 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	SPSB4	Q96A44	273 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	RUNDC1	Q96C34	613 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	LRGUK	Q96M69	825 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GCFC2-209	ENST00000486016	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016		H7C4K7	107 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	MYB	P10242	640 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	CTSA	P10619	480 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	HGF	P14210	728 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	SLC7A1	P30825	629 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	CFHR3	Q02985	330 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	INSC	Q1MX18	579 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	SUCLG2	Q96I99	432 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	MARK4	Q96L34	752 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	SNX15	Q9NRS6	342 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	HEY2	Q9UBP5	337 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	TMPRSS11D	O60235	418 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	TOMM40	O96008	361 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	PDGFRB	P09619	1106 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	ZNF91	Q05481	1191 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	DEUP1	Q05D60	604 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	APOA5	Q6Q788	366 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	L1RE1	Q9UN81	338 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	CD8B2	A6NJW9	211 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	EXOC5	O00471	708 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	FRS3	O43559	492 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	OAZ2	O95190	189 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	RASAL1	O95294	804 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	FGF2	P09038	288 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	KLRC1	P26715	233 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	GATM	P50440	423 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	ID2	Q02363	134 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	DKK4	Q9UBT3	224 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	CAPN8	A6NHC0	703 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016		A8MVJ9	347 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	ISM1	B1AKI9	464 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	CLIC1	O00299	241 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	RNF8	O76064	485 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	ALPL	P05186	524 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	IL1R1	P14778	569 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	THBS3	P49746	956 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	GPC5	P78333	572 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GCFC2-209	ENST00000486016	SLC14A1	Q13336	389 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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