RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 A0A1W2PQH9 124 aa21.9■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 SHISA7A6NL88 538 aa21.9■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 FAM170BA6NMN3 283 aa21.9■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa21.9■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 TULP2O00295 520 aa21.9■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 CALCAP01258 141 aa21.9■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 CTHP32929 405 aa21.9■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 PLA2G4AP47712 749 aa21.9■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 TKTL1P51854 596 aa21.9■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 CNGA2Q16280 664 aa21.9■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 KLHL40Q2TBA0 621 aa21.9■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 RAB41Q5JT25 222 aa21.9■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 PRSS33Q8NF86 280 aa21.9■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 ATP2A3Q93084 1043 aa21.9■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 ZSWIM1Q9BR11 485 aa21.9■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 NMUR1Q9HB89 426 aa21.9■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 LRRC4Q9HBW1 653 aa21.9■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 SIX2Q9NPC8 291 aa21.9■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 CYLDQ9NQC7 956 aa21.9■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 NAGPAQ9UK23 515 aa21.9■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 ARSAP15289 507 aa21.89■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 ADIGQ0VDE8 80 aa21.89■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 KRT31Q15323 416 aa21.89■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 ANO6Q4KMQ2 910 aa21.89■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 PKDCCQ504Y2 493 aa21.89■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 CPA6Q8N4T0 437 aa21.89■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 OSER1Q9NX31 292 aa21.89■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 CFAP97Q9P2B7 532 aa21.89■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 NCAM2O15394 837 aa21.88■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 RARGP13631 454 aa21.88■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 GNA15P30679 374 aa21.88■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 USP8P40818 1118 aa21.88■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa21.88■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 DTWD2Q8NBA8 298 aa21.88■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa21.88■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 SHC3Q92529 594 aa21.88■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 ULBP1Q9BZM6 244 aa21.88■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 VPS16Q9H269 839 aa21.88■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP21.88■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa21.88■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 MYOFQ9NZM1 2061 aa21.88■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa21.87■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 EML3Q32P44 896 aa21.87■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 SCD5Q86SK9 330 aa21.87■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 TADA2BQ86TJ2 420 aa21.87■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 ARHGAP18Q8N392 663 aa21.87■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 AOPEPQ8N6M6 819 aa21.87■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 KIAA1958Q8N8K9 716 aa21.87■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 KCTD13Q8WZ19 329 aa21.87■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 CLIC5Q9NZA1 410 aa21.87■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 DNAJC12Q9UKB3 198 aa21.87■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa21.87■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 BECN2A8MW95 431 aa21.86■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 THAP12O43422 761 aa21.86■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 MED7O43513 233 aa21.86■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 NFATC1O95644 943 aa21.86■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 ZBED1O96006 694 aa21.86■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 RALAP11233 206 aa21.86■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 MAGEA9P43362 315 aa21.86■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 PTPN5P54829 565 aa21.86■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 TXNDC11Q6PKC3 985 aa21.86■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 ECT2Q9H8V3 914 aa21.86■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 TBX18O95935 607 aa21.85■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 IRF1P10914 325 aa21.85■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 RGS7P49802 495 aa21.85■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP21.85■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 GOLGA8FQ08AF8 430 aa21.85■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa21.85■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 KCNMA1Q12791 1236 aa21.85■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 C10orf120Q5SQS8 335 aa21.85■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 FKBP15Q5T1M5 1219 aa21.85■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 SLC35F5Q8WV83 523 aa21.85■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 NUDT5Q9UKK9 219 aa21.85■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 E2F8A0AVK6 867 aa21.85■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 LCP1P13796 627 aa21.85■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 AMPD2Q01433 879 aa21.85■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 TCF15Q12870 199 aa21.85■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 RAPGEF1Q13905 1077 aa21.85■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 NCAPHQ15003 741 aa21.85■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 MEA1Q16626 185 aa21.85■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 SMYD5Q6GMV2 418 aa21.85■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 PM20D1Q6GTS8 502 aa21.85■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 PMF1Q6P1K2 205 aa21.85■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 KLHDC10Q6PID8 442 aa21.85■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 ZNF687Q8N1G0 1237 aa21.85■■□□□ 1.09
NELFE-208ENST00000481121 CLDN23Q96B33 292 aa21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms