RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 TKTP29401 623 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 PGM1P36871 562 aa7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 ACADSBP45954 432 aa7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 CTAG1AP78358 180 aa7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 COG7P83436 770 aa7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 CALCOCO2Q13137 446 aa7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 DNAJC3Q13217 504 aa7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 DLGAP5Q15398 846 aa7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 MMEL1Q495T6 779 aa7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 STYK1Q6J9G0 422 aa7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 DCDC5Q6ZRR9 648 aa7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 USP49Q70CQ1 688 aa7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 ZNF804AQ7Z570 1209 aa7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 SATL1Q86VE3 508 aa7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 KBTBD2Q8IY47 623 aa7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 PDPRQ8NCN5 879 aa7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 ICA1LQ8NDH6 482 aa7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 ZFP28Q8NHY6 868 aa7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 FBXO25Q8TCJ0 367 aa7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 TNFRSF25Q93038 417 aa7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 MASTLQ96GX5 879 aa7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 DYDC2Q96IM9 177 aa7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 SCYL1Q96KG9 808 aa7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 PSMB7Q99436 277 aa7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 OSMRQ99650 979 aa7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 MIPEPQ99797 713 aa7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 TSG101Q99816 390 aa7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 SYT17Q9BSW7 474 aa7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 RUSC1Q9BVN2 902 aa7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 VPS11Q9H270 941 aa7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 SEMA4AQ9H3S1 761 aa7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 ZNF287Q9HBT7 754 aa7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 MAGEE1Q9HCI5 957 aa7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 CABP5Q9NP86 173 aa7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 FKBP14Q9NWM8 211 aa7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 TAS2R1Q9NYW7 299 aa7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 KLHL3Q9UH77 587 aa7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 GTF3C4Q9UKN8 822 aa7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 IKBKGQ9Y6K9 419 aa7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa7.46□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 LTBP1Q14766 1721 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa7.45□□□□□ -1.22
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PKP4-211ENST00000481115 H0YIN7 160 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 KLF11O14901 512 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 TM9SF1O15321 606 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 ITM2AO43736 263 aa7.45□□□□□ -1.22
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PKP4-211ENST00000481115 BBOX1O75936 387 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 H2AFZP0C0S5 128 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 SPATA31D3P0C874 917 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 PCP11498 1178 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 DPEP1P16444 411 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 RPL17P18621 184 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 CALML3P27482 149 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 CHRNA5P30532 468 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 GRIA4P48058 902 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 ALDH3B2P48448 385 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 GSSP48637 474 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 PCYT1AP49585 367 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 GPC3P51654 580 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 PLTPP55058 493 aa7.45□□□□□ -1.22
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PKP4-211ENST00000481115 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
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PKP4-211ENST00000481115 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 UBE3CQ15386 1083 aa7.45□□□□□ -1.22
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PKP4-211ENST00000481115 MOGQ16653 247 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 RGS21Q2M5E4 152 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 FAM83BQ5T0W9 1011 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 TMEM63BQ5T3F8 832 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 SPOPLQ6IQ16 392 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 LMBR1LQ6UX01 489 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 H2AFVQ71UI9 128 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 MIER3Q7Z3K6 550 aa7.45□□□□□ -1.22
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