RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477087.1

CDKN1B-204, Transcript of cyclin dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

TSL 3

Gene CDKN1B, Length 453 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1B-204ENST00000477087 PHC1P78364 1004 aa6.45□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 VGLL4Q14135 290 aa6.45□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 SPIDRQ14159 915 aa6.45□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 LETM2Q2VYF4 491 aa6.45□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 LONRF3Q496Y0 759 aa6.45□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa6.45□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 FOXR2Q6PJQ5 311 aa6.45□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 Q6ZRM9 215 aa6.45□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 RASGRP2Q7LDG7 609 aa6.45□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 UNC5BQ8IZJ1 945 aa6.45□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 SPICE1Q8N0Z3 855 aa6.45□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 ZNF610Q8N9Z0 462 aa6.45□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 MLKLQ8NB16 471 aa6.45□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 CNNM3Q8NE01 707 aa6.45□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 HAS1Q92839 578 aa6.45□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 CDCA5Q96FF9 252 aa6.45□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 GPR87Q9BY21 358 aa6.45□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 ANO3Q9BYT9 981 aa6.45□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 TMEM60Q9H2L4 133 aa6.45□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 SPTLC3Q9NUV7 552 aa6.45□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 CEP72Q9P209 647 aa6.45□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 FBXO40Q9UH90 709 aa6.45□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 PCDHA12Q9UN75 941 aa6.45□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 FRMPD4Q14CM0 1322 aa6.45□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 RPTORQ8N122 1335 aa6.45□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 VWA3AA6NCI4 1184 aa6.44□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 IKBKBO14920 756 aa6.44□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 FLOT1O75955 427 aa6.44□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 FKBP9O95302 570 aa6.44□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 ADH4P08319 380 aa6.44□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 GAAP10253 952 aa6.44□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 MAKP20794 623 aa6.44□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 PPP1R2P41236 205 aa6.44□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 SCNN1GP51170 649 aa6.44□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 NRG3P56975 720 aa6.44□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 AMPD3Q01432 767 aa6.44□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 IKQ13123 557 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 KCNB1Q14721 858 aa6.44□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 CALCRLQ16602 461 aa6.44□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 STX1AQ16623 288 aa6.44□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 TMEM266Q2M3C6 531 aa6.44□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 CEP55Q53EZ4 464 aa6.44□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 COBLL1Q53SF7 1204 aa6.44□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa6.44□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 USP17L6PQ6QN14 398 aa6.44□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 B3GNT9Q6UX72 402 aa6.44□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 FKBP9P1Q75LS8 142 aa6.44□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 PIBF1Q8WXW3 757 aa6.44□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 LENG9Q96B70 501 aa6.44□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 EPSTI1Q96J88 318 aa6.44□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 PDLIM2Q96JY6 352 aa6.44□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 PPP1R9BQ96SB3 815 aa6.44□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 IWS1Q96ST2 819 aa6.44□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 RIT2Q99578 217 aa6.44□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 SOX7Q9BT81 388 aa6.44□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 TEX13BQ9BXU2 312 aa6.44□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 NT5C3AQ9H0P0 336 aa6.44□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 EPC1Q9H2F5 836 aa6.44□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 FBXO28Q9NVF7 368 aa6.44□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 KCNG1Q9UIX4 513 aa6.44□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 SSC5DA1L4H1 1573 aa6.44□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 SBF1O95248 1867 aa6.43□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa6.43□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa6.43□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 SMTNL1A8MU46 457 aa6.43□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa6.43□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 SUV39H1O43463 412 aa6.43□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 ALDH1A2O94788 518 aa6.43□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 SLC25A27O95847 323 aa6.43□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 PFKMP08237 780 aa6.43□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 DEKP35659 375 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 GPR15P49685 360 aa6.43□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 INHBEP58166 350 aa6.43□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 SETQ01105 290 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 PPP2R5CQ13362 524 aa6.43□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 MORC3Q14149 939 aa6.43□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 IQCB1Q15051 598 aa6.43□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 POSTNQ15063 836 aa6.43□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 TERF2Q15554 542 aa6.43□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 CAMK4Q16566 473 aa6.43□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 KRT79Q5XKE5 535 aa6.43□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.43□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 FRMD7Q6ZUT3 714 aa6.43□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 USP49Q70CQ1 688 aa6.43□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 CEP57L1Q8IYX8 460 aa6.43□□□□□ -1.38
CDKN1B-204ENST00000477087 ETNPPLQ8TBG4 499 aa6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms