RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475558.5

SHQ1-207, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-207ENST00000475558 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 DZANK1Q9NVP4 752 aa7.39□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 ASNSD1Q9NWL6 643 aa7.39□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 RRN3Q9NYV6 651 aa7.39□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 LIMD1Q9UGP4 676 aa7.39□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 L1RE1Q9UN81 338 aa7.39□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 SAR1BQ9Y6B6 198 aa7.39□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 CACNA1AO00555 2505 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 NCANO14594 1321 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 MACROD2A1Z1Q3 448 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 CCDC66A2RUB6 948 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 SPTLC1O15269 473 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 DDHD2O94830 711 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 MICAL2O94851 1124 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 ASGR2P07307 311 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 PDGFRBP09619 1106 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 FAM200BP0CF97 657 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 KRT3P12035 628 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 AOC1P19801 751 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 MAN1A1P33908 653 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 CA8P35219 290 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 PLA2G4AP47712 749 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 TUFMP49411 452 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 BCAR1P56945 870 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 PKDCCQ504Y2 493 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 LRRC38Q5VT99 294 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 NAA35Q5VZE5 725 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF280DQ6N043 979 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 C11orf63Q6NUN7 778 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 MON1BQ7L1V2 547 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 BEND5Q7L4P6 421 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 PEX26Q7Z412 305 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 DAAM2Q86T65 1068 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 ACOT1Q86TX2 421 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF280BQ86YH2 543 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 CCDC105Q8IYK2 499 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 SLC39A11Q8N1S5 342 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 C3orf20Q8ND61 904 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 TPCN2Q8NHX9 752 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 SLC20A1Q8WUM9 679 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 MAIP1Q8WWC4 291 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 CPA5Q8WXQ8 436 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 TFAP2BQ92481 460 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF592Q92610 1267 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 GOLGA1Q92805 767 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF653Q96CK0 615 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 SMARCD1Q96GM5 515 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 TMEM169Q96HH4 297 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 SYT15Q9BQS2 421 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 TTPALQ9BTX7 342 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 THAP2Q9H0W7 228 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 LRRC4Q9HBW1 653 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 RNF19AQ9NV58 838 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 CDH22Q9UJ99 828 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 CDC23Q9UJX2 597 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 TSPAN16Q9UKR8 245 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 BACE2Q9Y5Z0 518 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 MYO15AQ9UKN7 3530 aa7.38□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 VPS13AQ96RL7 3174 aa7.37□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 USP27XA6NNY8 438 aa7.37□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 MEIS3P2A8K0S8 358 aa7.37□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 TMCO5BA8MYB1 307 aa7.37□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 M0QYV0 167 aa7.37□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 TRIM66O15016 1216 aa7.37□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 RNF8O76064 485 aa7.37□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 URI1O94763 535 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 NPR3P17342 541 aa7.37□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 ABCB4P21439 1286 aa7.37□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 FGFR3P22607 806 aa7.37□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 BRD2P25440 801 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 LMO2P25791 158 aa7.37□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 PBX3P40426 434 aa7.37□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 MAGEA11P43364 429 aa7.37□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 COPS2P61201 443 aa7.37□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 SLC6A3Q01959 620 aa7.37□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 GPR17Q13304 367 aa7.37□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 MAMLD1Q13495 774 aa7.37□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 TDGQ13569 410 aa7.37□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 ANGPT1Q15389 498 aa7.37□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 HADHQ16836 314 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 CFAP221Q4G0U5 840 aa7.37□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 ODF2Q5BJF6 829 aa7.37□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SHQ1-207ENST00000475558 MEI1Q5TIA1 1274 aa7.37□□□□□ -1.23
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